RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 PDHA1P08559 390 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 SERPINF2P08697 491 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 MED14OSP0DP75 135 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 SP100P23497 879 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 PAX7P23759 505 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 CPOXP36551 454 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 CSKP41240 450 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 SGSHP51688 502 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLK1P53350 603 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 GEMP55040 296 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 CDH17Q12864 832 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 LMAN2Q12907 356 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 MPP3Q13368 585 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ITGA9Q13797 1035 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 GSTA3Q16772 222 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 AAK1Q2M2I8 961 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 GAB4Q2WGN9 574 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 CFAP157Q5JU67 520 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 METTL21CQ5VZV1 264 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCTD11Q693B1 232 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ALG1LQ6GMV1 187 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM154Q6P9G4 183 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 PARM1Q6UWI2 310 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 CES3Q6UWW8 571 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 VITQ6UXI7 678 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 MAVSQ7Z434 540 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 CMC1Q7Z7K0 106 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 CLEC14AQ86T13 490 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 LINC00523Q86TU6 105 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 LCA5Q86VQ0 697 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCNMB4Q86W47 210 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 AHI1Q8N157 1196 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 NPWQ8N729 165 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR6Y1Q8NGX8 325 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 FBXO27Q8NI29 283 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 JADE3Q92613 823 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 CMTM5Q96DZ9 223 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPDL1Q96EA4 605 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYEOVQ96EZ4 313 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZFYVE19Q96K21 471 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 CLPTM1LQ96KA5 538 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 PANX3Q96QZ0 392 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 IL12RB2Q99665 862 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 KXD1Q9BQD3 176 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 GORASP1Q9BQQ3 440 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 IL22Q9GZX6 179 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 RNF32Q9H0A6 362 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 GLOD4Q9HC38 313 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ABCB8Q9NUT2 735 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 EPS15L1Q9UBC2 864 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC7A8Q9UHI5 535 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A088AWK7 358 aa5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 G3V2L1 256 aa5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF195O14628 629 aa5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 GIPC1O14908 333 aa5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 BAG2O95816 211 aa5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ASLP04424 464 aa5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 APODP05090 189 aa5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 CYP17A1P05093 508 aa5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 C2P06681 752 aa5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 LINGO3P0C6S8 592 aa5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 COL6A2P12110 1019 aa5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 COX4I1P13073 169 aa5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARSAP15289 507 aa5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ITGAXP20702 1163 aa5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 NFKBIAP25963 317 aa5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 POLD2P49005 469 aa5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 SCNN1BP51168 640 aa5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 RHOAP61586 193 aa5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC25A3Q00325 362 aa5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ECT2LQ008S8 904 aa5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 IRF9Q00978 393 aa5.54□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 PFKPQ01813 784 aa5.54□□□□□ -1.52
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