RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495867.1

MRPL9-211, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L9, human

TSL 2

Gene MRPL9, Length 403 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL9-211	ENST00000495867	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	CBR4	Q8N4T8	237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	URGCP	Q8TCY9	931 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	VAT1	Q99536	393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	SLC29A1	Q99808	456 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	CIB1	Q99828	191 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	TPK1	Q9H3S4	243 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	EHD1	Q9H4M9	534 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	CASS4	Q9NQ75	786 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	PXMP2	Q9NR77	195 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	CLDND1	Q9NY35	253 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	ADA2	Q9NZK5	511 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	NTM	Q9P121	344 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	COL20A1	Q9P218	1284 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	CNTNAP1	P78357	1384 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	LCT	P09848	1927 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	RLF	Q13129	1914 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867		A0A1B0GTW7	788 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867		H7BY64	318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	UBXN8	O00124	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	TAF4	O00268	1085 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	VWA5A	O00534	786 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	KMO	O15229	486 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	UGT2B11	O75310	529 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	VPS4B	O75351	444 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	JRK	O75564	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	FKBP9	O95302	570 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	AP2A1	O95782	977 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	PTTG1	O95997	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	KRT6A	P02538	564 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	KRT6B	P04259	564 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	CELA3B	P08861	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	CCDC159	P0C7I6	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	PDGFRA	P16234	1089 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	CYP2F1	P24903	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	ADORA2A	P29274	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	SDC4	P31431	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	ICAM3	P32942	547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	HPCAL1	P37235	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	ACOT2	P49753	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	CDH15	P55291	814 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	SNAP25	P60880	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	PHC1	P78364	1004 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	NFKB2	Q00653	900 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	PEX6	Q13608	980 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	PRKG1	Q13976	671 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	KCNJ8	Q15842	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	CYP2A13	Q16696	494 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL9-211	ENST00000495867	RFX4	Q33E94	735 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms