RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494672.1

CCDC66-222, Transcript of coiled-coil domain containing 66, human

TSL 4

Gene CCDC66, Length 577 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC66-222	ENST00000494672	ABCB4	P21439	1286 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	HOXA6	P31267	233 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	KRT2	P35908	639 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	AVPR1A	P37288	418 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	TEC	P42680	631 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	HNMT	P50135	292 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	MTTP	P55157	894 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	SULT2A1	Q06520	285 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ASPH	Q12797	758 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ZACN	Q401N2	412 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	TRIM60	Q495X7	471 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	GRTP1	Q5TC63	336 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672		Q6ZSV7	163 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	GPR142	Q7Z601	462 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ERO1B	Q86YB8	467 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	HACE1	Q8IYU2	909 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ARL14	Q8N4G2	192 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ATL1	Q8WXF7	558 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	HSPH1	Q92598	858 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	C19orf60	Q96EN9	201 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	MSANTD3	Q96H12	275 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	CCDC42	Q96M95	316 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	FAM20A	Q96MK3	541 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	CIB1	Q99828	191 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	CRB3	Q9BUF7	120 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	AZI2	Q9H6S1	392 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	LRRC19	Q9H756	370 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	LY9	Q9HBG7	655 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	IL37	Q9NZH6	218 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	HEATR9	A2RTY3	570 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	KRT87P	A6NCN2	255 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	AGAP5	A6NIR3	686 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	SNTN	A6NMZ2	147 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672		H0YIV9	168 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	SMIM24	O75264	130 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	FCGR1A	P12314	374 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ALOX12	P18054	663 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	HLA-DPA1	P20036	260 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ALDH3A1	P30838	453 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	PPP1R2	P41236	205 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	GNAQ	P50148	359 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	CDK7	P50613	346 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	KLC1	Q07866	573 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	GIT2	Q14161	759 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	STARD3	Q14849	445 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	DPYSL2	Q16555	572 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	BTBD16	Q32M84	506 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	PALB2	Q86YC2	1186 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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