RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 KRT39Q6A163 491 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 PET117Q6UWS5 81 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 ADCK2Q7Z695 626 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 MFN1Q8IWA4 741 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 MAP7D3Q8IWC1 876 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 OR5R1Q8NH85 324 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 PIGTQ969N2 578 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 C3orf30Q96M34 536 aa7.49□□□□□ -1.21
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PTPRC-212ENST00000491302 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
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PTPRC-212ENST00000491302 GTF3C4Q9UKN8 822 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 CCR10P46092 362 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 DDR1Q08345 913 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC184Q52MB2 194 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRC-212ENST00000491302 ATG9AQ7Z3C6 839 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRC-212ENST00000491302 PGBD5Q8N414 524 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 CAMKVQ8NCB2 501 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRC-212ENST00000491302 OR6C1Q96RD1 312 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 EGFL8Q99944 293 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRC-212ENST00000491302 A0A0B4J293 547 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PP11 408 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 C15orf62A8K5M9 175 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 C22orf31O95567 290 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 S1PR1P21453 382 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 ARRB2P32121 409 aa7.47□□□□□ -1.21
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PTPRC-212ENST00000491302 SLC44A1Q8WWI5 657 aa7.47□□□□□ -1.21
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PTPRC-212ENST00000491302 FAM162AQ96A26 154 aa7.47□□□□□ -1.21
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PTPRC-212ENST00000491302 SYT17Q9BSW7 474 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 WNT5BQ9H1J7 359 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa7.47□□□□□ -1.21
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PTPRC-212ENST00000491302 RASAL2Q9UJF2 1139 aa7.47□□□□□ -1.21
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PTPRC-212ENST00000491302 TO15178 435 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 MED24O75448 989 aa7.46□□□□□ -1.22
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PTPRC-212ENST00000491302 CLDN14O95500 239 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ACHEP22303 614 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ITGB8P26012 769 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 TMPOP42166 694 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 MTHFRP42898 656 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 CD81P60033 236 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 BNC1Q01954 994 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM35AQ53FP2 167 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 PLA2G4FQ68DD2 849 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 FIGLAQ6QHK4 219 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 FAM198BQ6UWH4 519 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ADHFE1Q8IWW8 467 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 IQUBQ8NA54 791 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 SLAMF9Q96A28 289 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 VMP1Q96GC9 406 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 SEPHS2Q99611 448 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ABHD6Q9BV23 337 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 SIX4Q9UIU6 781 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 OR2M5A3KFT3 312 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 MYMKA6NI61 221 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 CD8B2A6NJW9 211 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD66B4E2M5 251 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 MID1O15344 667 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 OAZ2O95190 189 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-212ENST00000491302 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
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