RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 FGF22Q9HCT0 170 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-208ENST00000481211 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
NISCH-208ENST00000481211 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-208ENST00000481211 TLDC2A0PJX2 215 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 CCDC189A1A4V9 331 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 MGAT4DA6NG13 374 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 OR2AG2A6NM03 316 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 TRIM49D1C9J1S8 452 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
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NISCH-208ENST00000481211 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
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NISCH-208ENST00000481211 RAB10P61026 200 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 ALG11Q2TAA5 492 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 MROH9Q5TGP6 573 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 SLC23A3Q6PIS1 610 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 DET1Q7L5Y6 550 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 OTOAQ7RTW8 1153 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 AMZ2Q86W34 360 aa12.83□□□□□ -0.36
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NISCH-208ENST00000481211 INPP5DQ92835 1189 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa12.83□□□□□ -0.36
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NISCH-208ENST00000481211 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 SLC39A10Q9ULF5 831 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 SUFUQ9UMX1 484 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 DHRS7Q9Y394 339 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 ACTL7BQ9Y614 415 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 PRSS21Q9Y6M0 314 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 ABCA7Q8IZY2 2146 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 SPAG17Q6Q759 2223 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 DOCK9Q9BZ29 2069 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 A0A087X1B8 175 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 HMX2A2RU54 273 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 DLL1O00548 723 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 NIPSNAP2O75323 286 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 POP7O75817 140 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 TRIM16O95361 564 aa12.82□□□□□ -0.36
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NISCH-208ENST00000481211 COL6A2P12110 1019 aa12.82□□□□□ -0.36
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NISCH-208ENST00000481211 TAS2R39P59534 338 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 ARHGAP8P85298 464 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 TCF15Q12870 199 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 GPS2Q13227 327 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 MICALCLQ6ZW33 695 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 NEK10Q6ZWH5 1172 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 C11orf96Q7Z7L8 435 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 ZNF547Q8IVP9 402 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 PHACTR4Q8IZ21 702 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 ZBTB2Q8N680 514 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 MZB1Q8WU39 189 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 OR1E3Q8WZA6 343 aa12.82□□□□□ -0.36
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NISCH-208ENST00000481211 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 NDNQ99608 321 aa12.82□□□□□ -0.36
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NISCH-208ENST00000481211 CYP4F12Q9HCS2 524 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 TBK1Q9UHD2 729 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 MOSPD1Q9UJG1 213 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 TLK1Q9UKI8 766 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 ACSL5Q9ULC5 683 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 SLC6A14Q9UN76 642 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 MED16Q9Y2X0 877 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 SMIM23A6NLE4 172 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 RETP07949 1114 aa12.81□□□□□ -0.36
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