RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-204ENST00000481204 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 RDH11Q8TC12 318 aa6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 SCAMP4Q969E2 229 aa6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 ARRDC3Q96B67 414 aa6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 SCRN2Q96FV2 425 aa6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM74Q96NL1 305 aa6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 HHIPQ96QV1 700 aa6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 TCF12Q99081 682 aa6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 EBF4Q9BQW3 602 aa6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 P2RY12Q9H244 342 aa6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF576Q9H609 170 aa6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 ASB8Q9H765 288 aa6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 THAP1Q9NVV9 213 aa6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 HEY2Q9UBP5 337 aa6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 IL36AQ9UHA7 158 aa6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 PRDM4Q9UKN5 801 aa6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 PPIL1Q9Y3C6 166 aa6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 USH1CQ9Y6N9 552 aa6.06□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 CDH23Q9H251 3354 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 TSPAN11A1L157 253 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 C16orf96A6NNT2 1141 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 A8MT66 165 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM233B4DJY2 109 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 H7C0S8 307 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 UBXN8O00124 270 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF195O14628 629 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 TGDSO95455 350 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 HSPA4LO95757 839 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 ASLP04424 464 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 APOA4P06727 396 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 TSPAN8P19075 237 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 CHRM3P20309 590 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 ITGALP20701 1170 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 GRK2P25098 689 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 SERPINB3P29508 390 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 VIPR1P32241 457 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 BMP8BP34820 402 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 SPAM1P38567 509 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 NNMTP40261 264 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 ETV3P41162 512 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 IL12RB1P42701 662 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 TTPAP49638 278 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 SUOXP51687 545 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 CORO7P57737 925 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 NCALDP61601 193 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 ST8SIA6P61647 398 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 B4GALNT1Q00973 533 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 FCHO2Q0JRZ9 810 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 RALGDSQ12967 914 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 NFATC2Q13469 925 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 TUBB3Q13509 450 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 FAM83EQ2M2I3 478 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 AGAP9Q5VTM2 703 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 LIPMQ5VYY2 423 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 CES5AQ6NT32 575 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 Q6ZVL8 140 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 USP45Q70EL2 814 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 SNX20Q7Z614 316 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 CACUL1Q86Y37 369 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 YAF2Q8IY57 180 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 CPNE9Q8IYJ1 553 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 NXPE1Q8N323 547 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 CPA6Q8N4T0 437 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 TERB1Q8NA31 727 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 MAPK15Q8TD08 544 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF398Q8TD17 642 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 CD200R1Q8TD46 325 aa6.05□□□□□ -1.44
SKAP2-204ENST00000481204 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms