RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460170.2

PTPRU-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,337 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-205ENST00000460170 PRKCZQ05513 592 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 GALNT5Q7Z7M9 940 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 SLC13A3Q8WWT9 602 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 SYT11Q9BT88 431 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 AKTIPQ9H8T0 292 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ATXN10Q9UBB4 475 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 FAM234BA2RU67 622 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 UNCXA6NJT0 531 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 AQP12BA6NM10 295 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ADH1CP00326 375 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 IL6P05231 212 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CYP4F2P78329 520 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CYP4F3Q08477 520 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 GPAT3Q53EU6 434 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 AQP12AQ8IXF9 295 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CHID1Q9BWS9 393 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 RHBGQ9H310 441 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 IGFLR1Q9H665 355 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ATP6V1HQ9UI12 483 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 BTBD3Q9Y2F9 522 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CENPXA8MT69 81 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 BCKDKO14874 412 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 NIPSNAP2O75323 286 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 NADKO95544 446 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ACLYP53396 1101 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 SKP1P63208 163 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 VN1R5Q7Z5H4 357 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 BORCS5Q969J3 196 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 OR2AG2A6NM03 316 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 FGF19O95750 216 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CHSY3Q70JA7 882 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 C16orf62Q7Z3J2 963 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 AP2M1Q96CW1 435 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 SCML2Q9UQR0 700 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 PIPSLA2A3N6 862 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 PER2O15055 1255 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 SATL1Q86VE3 508 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 KLHL1Q9NR64 748 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ABCB10Q9NRK6 738 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 OGDHLQ9ULD0 1010 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 KERAO60938 352 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 LPIN1Q14693 890 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ADGRF1Q5T601 910 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 DENND1AQ8TEH3 1009 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 FNDC11Q9BVV2 318 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 KAT6AQ92794 2004 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 A0A1B0GW55 424 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ILVBLA1L0T0 632 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 MATN2O00339 956 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CA12O43570 354 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 DUX4L2P0CJ85 424 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 DUX4L3P0CJ86 424 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 DUX4L4P0CJ87 422 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 DUX4L5P0CJ88 424 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 DUX4L6P0CJ89 424 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 DUX4L7P0CJ90 424 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ACVRL1P37023 503 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CHST9Q7L1S5 443 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 FGD2Q7Z6J4 655 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ANKRD46Q86W74 232 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 PARP8Q8N3A8 854 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 SLC38A2Q96QD8 506 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CXorf21Q9HAI6 301 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 DUX4Q9UBX2 424 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 GPSM3Q9Y4H4 160 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ALS2Q96Q42 1657 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF846Q147U1 533 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 PSMA8Q8TAA3 256 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 GIPC3Q8TF64 312 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 C8orf48Q96LL4 319 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 LRRC3Q9BY71 257 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CCSER2Q9H7U1 834 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 RASSF1Q9NS23 344 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 MYH7P12883 1935 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 ECI2O75521 394 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 RPS14P62263 151 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF544Q6NX49 715 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 DEF8Q6ZN54 512 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms