RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444685.1

CBX1-204, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CBX1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-204ENST00000444685 COX6B1P14854 86 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 NELFEP18615 380 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 SLC9A1P19634 815 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 CAPN3P20807 821 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 HTR7P34969 479 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 PTGER4P35408 488 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 VAV2P52735 878 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 AIF1P55008 147 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 STX17P56962 302 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 GSDMDP57764 484 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 ACY1Q03154 408 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 ART3Q13508 389 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 TUBB3Q13509 450 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 POU4F3Q15319 338 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 CCDC14Q49A88 953 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 TMTC4Q5T4D3 741 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 MANEALQ5VSG8 457 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 CPZQ66K79 652 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 ISM2Q6H9L7 571 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 IRGCQ6NXR0 463 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 GJB7Q6PEY0 223 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 LRFN4Q6PJG9 635 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 C20orf204Q6ZNR8 217 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 Q6ZVL8 140 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 USP45Q70EL2 814 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 TMEM126BQ8IUX1 230 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 TRIM59Q8IWR1 403 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 Q8NA96 180 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 CLEC1AQ8NC01 280 aa5.05□□□□□ -1.6
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CBX1-204ENST00000444685 OR8K5Q8NH50 307 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 FAM172AQ8WUF8 416 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 TEKT4Q8WW24 435 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 NELFBQ8WX92 580 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 RXFP2Q8WXD0 754 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 CPA5Q8WXQ8 436 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 VOPP1Q96AW1 172 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 ECHDC3Q96DC8 303 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 RNF31Q96EP0 1072 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 DTD2Q96FN9 168 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 SCRN2Q96FV2 425 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 PLPPR2Q96GM1 343 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 LURAP1Q96LR2 239 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 IP6K3Q96PC2 410 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 KLC2Q9H0B6 622 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 BRD8Q9H0E9 1235 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 UCK1Q9HA47 277 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 SP110Q9HB58 689 aa5.05□□□□□ -1.6
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CBX1-204ENST00000444685 TMEM59LQ9UK28 342 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 DNAJC12Q9UKB3 198 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 POLEQ07864 2286 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 CCDC168Q8NDH2 2452 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 ANKRD36A6QL64 1941 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 LRP4O75096 1905 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
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CBX1-204ENST00000444685 LILRA5A6NI73 299 aa5.04□□□□□ -1.6
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CBX1-204ENST00000444685 B2RBV5 119 aa5.04□□□□□ -1.6
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CBX1-204ENST00000444685 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 ZG16O60844 167 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 SCRG1O75711 98 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 MTA2O94776 668 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 CPP00450 1065 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 CD63P08962 238 aa5.04□□□□□ -1.6
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CBX1-204ENST00000444685 VCLP18206 1134 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 AGXTP21549 392 aa5.04□□□□□ -1.6
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CBX1-204ENST00000444685 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 PTPN9P43378 593 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 MAP2K3P46734 347 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 EPHB1P54762 984 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 GYS2P54840 703 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 HDAC4P56524 1084 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 TPI1P60174 286 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 RPS18P62269 152 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 HSD11B2P80365 405 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 RAPSNQ13702 412 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 ZNF235Q14590 738 aa5.04□□□□□ -1.6
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