RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428331.6

ATP2C1-204, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATP2C1, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1-204ENST00000428331 ARRDC4Q8NCT1 418 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 HMCESQ96FZ2 354 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 PARVBQ9HBI1 364 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 STX16O14662 325 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 SNPHO15079 494 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 STX7O15400 261 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 KPNA6O60684 536 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 XYLBO75191 536 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 CCDC159P0C7I6 412 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 DNASE1L3Q13609 305 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 SGO1Q5FBB7 561 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 TAPT1Q6NXT6 567 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 DTWD1Q8N5C7 304 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 OR13J1Q8NGT2 312 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 ESAMQ96AP7 390 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 TRIM64A6NGJ6 449 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 NFKBIEO00221 500 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 RGS14O43566 566 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 ZNF682O95780 498 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 GSTT2P0CG29 244 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 GSTT2BP0CG30 244 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 ITIH1P19827 911 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 IL18R1Q13478 541 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 SPCS2Q15005 226 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 OXA1LQ15070 435 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 RAB41Q5JT25 222 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 CYP20A1Q6UW02 462 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 AMER2Q8N7J2 671 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 PIK3C3Q8NEB9 887 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 BPIFB1Q8TDL5 484 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 NSMCE3Q96MG7 304 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 ALPK1Q96QP1 1244 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 CORO1BQ9BR76 489 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 TMEM45AQ9NWC5 275 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa10.64□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 SHROOM3Q8TF72 1996 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 SIP14410 1827 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 SAGE2PA6NJ88 616 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 FKBP9O95302 570 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 IGFBP5P24593 272 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 RPL9P32969 192 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 RGS4P49798 205 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 CLCNKBP51801 687 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 RPL38P63173 70 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 GALNT3Q14435 633 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 TBPL2Q6SJ96 375 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 ZFAND4Q86XD8 727 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 EFHBQ8N7U6 833 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 ATG16L2Q8NAA4 619 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 OR13C4Q8NGS5 318 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 SCAMP5Q8TAC9 235 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 PEX13Q92968 403 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 PSMG2Q969U7 264 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 RMND5AQ9H871 391 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 NECTIN3Q9NQS3 549 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 ARL5AQ9Y689 179 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 TCRBV5S2A0A599 114 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 GRXCR2A6NFK2 248 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 J3KR12 359 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 SLC1A7O00341 560 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 CXCR6O00574 342 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 AQP9O43315 295 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 RGS10O43665 173 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 GPR32O75388 356 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 PRKD3O94806 890 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 CHRNA1P02708 482 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 CYP11A1P05108 521 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 CAPN1P07384 714 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 HMBSP08397 361 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 INHBBP09529 407 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 PKMP14618 531 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 PBX3P40426 434 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 STC1P52823 247 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 DGKQP52824 942 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 MFSD10Q14728 455 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 ACOX1Q15067 660 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 NPTX1Q15818 432 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 MARCH8Q5T0T0 291 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 MSANTD2Q6P1R3 559 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 LINC00299Q6ZSB3 139 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 SLC22A16Q86VW1 577 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 ARMC8Q8IUR7 673 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 CAPSLQ8WWF8 208 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 SLC13A3Q8WWT9 602 aa10.63□□□□□ -0.71
ATP2C1-204ENST00000428331 HTRA1Q92743 480 aa10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms