RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAD51BO15315 384 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BNIP3LO60238 219 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 S100BP04271 92 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LYNP07948 512 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DGKAP23743 735 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SEMG2Q02383 582 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRIK2Q13002 908 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ICA1LQ8NDH6 482 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR26Q8NDV2 337 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCRN2Q96FV2 425 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC45A3Q96JT2 553 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BTBD9Q96Q07 612 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCT7Q99832 543 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PKP2Q99959 881 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ST14Q9Y5Y6 855 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZBBXA8MT70 800 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AGAP14A8MT82 685 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FXYD1O00168 92 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CSPG5O95196 566 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GLUD1P00367 558 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RHDQ02161 417 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COQ5Q5HYK3 327 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPRC6AQ5T6X5 926 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRC66Q68CR7 880 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MACC1Q6ZN28 852 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TPRG1Q6ZUI0 275 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZBTB2Q8N680 514 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP6V1E2Q96A05 226 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DCUN1D1Q96GG9 259 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCF25Q9BQ70 676 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BRINP2Q9C0B6 783 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SUV39H2Q9H5I1 410 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL1RL2Q9HB29 575 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RIC8BQ9NVN3 520 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABCD2Q9UBJ2 740 aa18.45■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR7A17O14581 309 aa18.44■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VCLP18206 1134 aa18.44■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GJA8P48165 433 aa18.44■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERVFC1P60507 584 aa18.44■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERVK-8P63133 956 aa18.44■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MED21Q13503 144 aa18.44■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RCAN2Q14206 197 aa18.44■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL23RQ5VWK5 629 aa18.44■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRMT9Q6P2P2 845 aa18.44■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 USP45Q70EL2 814 aa18.44■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM25Q86YD3 366 aa18.44■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MINDY1Q8N5J2 469 aa18.44■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSPEARQ8WU66 669 aa18.44■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TLR9Q9NR96 1032 aa18.44■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPIL1Q9Y3C6 166 aa18.44■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OARD1Q9Y530 152 aa18.44■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa18.44■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NME4O00746 187 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRM6O15303 877 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAJA2O60884 412 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTPN5P54829 565 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GTF2H2Q13888 395 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAP7D1Q3KQU3 841 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TICAM1Q8IUC6 712 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CATSPER1Q8NEC5 780 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADCY4Q8NFM4 1077 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCEAL4Q96EI5 215 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASIC4Q96FT7 647 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TEX37Q96LM6 180 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL23AQ9NPF7 189 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ELOVL2Q9NXB9 296 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HIDE1A8MVS5 230 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GUCA1CO95843 209 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAPNS1P04632 268 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAPN1P07384 714 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LHCGRP22888 699 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C6orf136Q5SQH8 315 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYP2R1Q6VVX0 501 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 Q6ZSR9 355 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR4F6Q8NGB9 312 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 METTL6Q8TCB7 284 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1orf50Q9BV19 199 aa18.43■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.3 ms