RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 RPA4Q13156 261 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 POM121L1PQ3SYA9 428 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 RAET1GQ6H3X3 334 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM220Q6QAJ8 160 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 CYHR1Q6ZMK1 362 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 SPATA21Q7Z572 469 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 TRIM69Q86WT6 500 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 GPSM1Q86YR5 675 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 TCAIMQ8N3R3 496 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 CAMKK1Q8N5S9 505 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 OR14C36Q8NHC7 312 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 L3HYPDHQ96EM0 354 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 COX14Q96I36 57 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 SEC16BQ96JE7 1060 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 MRGPRX1Q96LB2 322 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 FOPNLQ96NB1 174 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 HIST1H2AJQ99878 128 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 H2AFJQ9BTM1 129 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 TEX101Q9BY14 249 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 BTBD1Q9H0C5 482 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 PCED1AQ9H1Q7 454 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 PFDN4Q9NQP4 134 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 ARHGEF3Q9NR81 526 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 MRGBPQ9NV56 204 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 XPR1Q9UBH6 696 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 VTI1BQ9UEU0 232 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 CD84Q9UIB8 345 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 HAO1Q9UJM8 370 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 FBXL21Q9UKT6 434 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 RNF112Q9ULX5 631 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 RAP2CQ9Y3L5 183 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 ANKRD12Q6UB98 2062 aa9.46□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 SHISA7A6NL88 538 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 FAM170BA6NMN3 283 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 FADS2P1A8MWK0 482 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 ZBTB14O43829 449 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 SNX2O60749 519 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 TSPAN12O95859 305 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 S100BP04271 92 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 SBK3P0C264 359 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 VCLP18206 1134 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 KELP23276 732 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 RPS9P46781 194 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 GLRBP48167 497 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 PRLHRP49683 370 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 HNMTP50135 292 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 CCR5P51681 352 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 YPEL5P62699 121 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 HERVK_113P63132 956 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 IRX4P78413 519 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 BST1Q10588 318 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 SP140Q13342 867 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 RCN2Q14257 317 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 GBX1Q14549 363 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF460Q14592 562 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 WSCD2Q2TBF2 565 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM259Q4ZIN3 620 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 LRRC73Q5JTD7 316 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 ANKS6Q68DC2 871 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 SULT1C3Q6IMI6 304 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 RFLNAQ6ZTI6 216 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF687Q8N1G0 1237 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 CLDN19Q8N6F1 224 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 PHC3Q8NDX5 983 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 MAGEC3Q8TD91 643 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 MCOLN3Q8TDD5 553 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 CLDN23Q96B33 292 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM159Q96B96 161 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 SGF29Q96ES7 293 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 LINGO1Q96FE5 620 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 ATOH8Q96SQ7 321 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 TUBB6Q9BUF5 446 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 BOCQ9BWV1 1114 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 ERVK-6Q9BXR3 956 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 ALG9Q9H6U8 611 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 LTB4R2Q9NPC1 389 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 KCNK4Q9NYG8 393 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 NUDT4Q9NZJ9 180 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms