RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1B0GTL3 188 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 UBDO15205 165 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CFLARO15519 480 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 LEFTY1O75610 366 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 KRT36O76013 467 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 PDE5AO76074 875 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 GUCA1CO95843 209 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CYP17A1P05093 508 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 VAMP1P23763 118 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 PRDX6P30041 224 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 DGKGP49619 791 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 NUDT2P50583 147 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 RAP1GDS1P52306 607 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ARHGEF7Q14155 803 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 DMC1Q14565 340 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 TGFBIQ15582 683 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 GPR33Q49SQ1 333 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 TCEAL5Q5H9L2 206 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 C1orf146Q5VVC0 180 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 AHI1Q8N157 1196 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 NXPE1Q8N323 547 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 STMN2Q93045 179 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 OTUB2Q96DC9 234 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 RSPRY1Q96DX4 576 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 C3orf30Q96M34 536 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ASB2Q96Q27 587 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 LYSMD1Q96S90 227 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 HEPHQ9BQS7 1158 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 RTKNQ9BST9 563 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 HGH1Q9BTY7 390 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 EBF3Q9H4W6 596 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 IGFLR1Q9H665 355 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 DCLRE1BQ9H816 532 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 MEAF6Q9HAF1 191 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ZBTB26Q9HCK0 441 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 GIMAP2Q9UG22 337 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CDH22Q9UJ99 828 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 DOLKQ9UPQ8 538 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC8A2Q9UPR5 921 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 BTRCQ9Y297 605 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 TIMM22Q9Y584 194 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKRD12Q6UB98 2062 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 NOTCH4Q99466 2003 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 SOBPA7XYQ1 873 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 GIPC1O14908 333 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 PIP5K1BO14986 540 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00032P0C843 101 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ADH5P11766 374 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CD9P21926 228 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 XPAP23025 273 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 SPINT3P49223 89 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 RGS4P49798 205 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 NME5P56597 212 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 SATB1Q01826 763 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 MESP2Q0VG99 397 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 LCP2Q13094 533 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 RCN1Q15293 331 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 SHHQ15465 462 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 RBBP7Q16576 425 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 UGT3A2Q3SY77 523 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 SCIMPQ6UWF3 145 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CYHR1Q6ZMK1 362 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 GK5Q6ZS86 529 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 DET1Q7L5Y6 550 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 C12orf40Q86WS4 652 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 MYO1HQ8N1T3 1032 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 KYQ8NBH2 561 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 HIPK4Q8NE63 616 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ACTRT2Q8TDY3 377 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 TWIST2Q8WVJ9 160 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 FOXJ1Q92949 421 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 SCAMP4Q969E2 229 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 RCN3Q96D15 328 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 C19orf60Q96EN9 201 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 MRGPRX3Q96LB0 322 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 PANX3Q96QZ0 392 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 COPS8Q99627 209 aa3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms