RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395833.7

LMO2-202, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 1,687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-202ENST00000395833 TDGQ13569 410 aa29■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 CRY1Q16526 586 aa29■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 SLC44A4Q53GD3 710 aa29■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 ZNF678Q5SXM1 525 aa29■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 CCT6BQ92526 530 aa29■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 WWP1Q9H0M0 922 aa29■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 CD274Q9NZQ7 290 aa29■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 OR2AG2A6NM03 316 aa28.99■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 SNX2O60749 519 aa28.99■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 FTH1P02794 183 aa28.99■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 CBSLP0DN79 551 aa28.99■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 CBSP35520 551 aa28.99■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 HERVK_113P63132 956 aa28.99■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa28.99■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 ERVK-6Q9BXR3 956 aa28.99■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 TMCO1Q9UM00 188 aa28.99■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 SUPT7LO94864 414 aa28.99■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 AOAHP28039 575 aa28.99■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 ZBTB16Q05516 673 aa28.99■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 FBXO43Q4G163 708 aa28.99■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa28.99■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 GUCD1Q96NT3 240 aa28.99■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa28.99■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 HEY2Q9UBP5 337 aa28.99■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 SGTAO43765 313 aa28.98■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 UNC50Q53HI1 259 aa28.98■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 EOGTQ5NDL2 527 aa28.98■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 FRMD7Q6ZUT3 714 aa28.98■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 TRIM74Q86UV6 250 aa28.98■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 NLRP8Q86W28 1048 aa28.98■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 ELMO1Q92556 727 aa28.98■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 LRRC37BQ96QE4 947 aa28.98■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 KDM4CQ9H3R0 1056 aa28.98■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 GSTO2Q9H4Y5 243 aa28.98■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 NUDT4Q9NZJ9 180 aa28.98■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 MYO10Q9HD67 2058 aa28.98■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 KPNA5O15131 536 aa28.97■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 CD72P21854 359 aa28.97■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 RPL14P50914 215 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 HK3P52790 923 aa28.97■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 CTSCP53634 463 aa28.97■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 HSPA14Q0VDF9 509 aa28.97■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 SEL1L3Q68CR1 1132 aa28.97■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 FITM2Q8N6M3 262 aa28.97■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 S100BP04271 92 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 PCCBP05166 539 aa28.96■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa28.96■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 OR14C36Q8NHC7 312 aa28.96■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 SIPA1Q96FS4 1042 aa28.96■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 RILPQ96NA2 401 aa28.96■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 TRMOQ9BU70 441 aa28.96■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa28.96■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 HAO1Q9UJM8 370 aa28.96■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 PRR23AA6NEV1 266 aa28.96■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 LRRC14BA6NHZ5 514 aa28.96■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 IL9P15248 144 aa28.96■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 TGFBIQ15582 683 aa28.96■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 TMEM220Q6QAJ8 160 aa28.96■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 SBSNQ6UWP8 590 aa28.96■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 CYHR1Q6ZMK1 362 aa28.96■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 MAVSQ7Z434 540 aa28.96■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 ERP27Q96DN0 273 aa28.96■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 MYLK2Q9H1R3 596 aa28.96■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 DNAJC28Q9NX36 388 aa28.96■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 FAM8A1Q9UBU6 413 aa28.96■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 SHISA7A6NL88 538 aa28.95■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa28.95■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 STX16O14662 325 aa28.95■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 RAD51BO15315 384 aa28.95■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 KLK8O60259 260 aa28.95■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 ATG13O75143 517 aa28.95■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 SERPINB3P29508 390 aa28.95■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 PRLHRP49683 370 aa28.95■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 GTF2H3Q13889 308 aa28.95■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 SH2D4BQ5SQS7 431 aa28.95■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
LMO2-202ENST00000395833 EBF4Q9BQW3 602 aa28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms