RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPATA6LQ8N4H0 392 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 GIMAP7Q8NHV1 300 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF358Q9NW07 568 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 AP2A2O94973 939 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 TDGF1P13385 188 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 CD9P21926 228 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM220Q6QAJ8 160 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 PAQR3Q6TCH7 311 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 NAPRTQ6XQN6 538 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLEC14AQ86T13 490 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 CD200R1Q8TD46 325 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANKRD49Q8WVL7 239 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 FOXJ1Q92949 421 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 POPDC3Q9HBV1 291 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 BCKDHBP21953 392 aa27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 GCNT7Q6ZNI0 430 aa27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC63Q8NA47 563 aa27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM145Q8NBT3 493 aa27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 KCTD4Q8WVF5 259 aa27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM216Q9P0N5 145 aa27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A087X1B8 175 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 VEGFDO43915 354 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLIN3O60664 434 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 IRX4P78413 519 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 DLG1Q12959 904 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 UGT3A1Q6NUS8 523 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 PANX3Q96QZ0 392 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 DHRS7Q9Y394 339 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A1W2PPC4 97 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 METTL12A8MUP2 240 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAP3K13O43283 966 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC166P0CW27 439 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 NEFHP12036 1026 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 GTF2H3Q13889 308 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZSCAN26Q16670 478 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC36A4Q6YBV0 504 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 DTWD2Q8NBA8 298 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 CADM4Q8NFZ8 388 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 ORAI3Q9BRQ5 295 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 MECRQ9BV79 373 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 MANSC1Q9H8J5 431 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 DMTF1Q9Y222 760 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCR7P32248 378 aa27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRLHRP49683 370 aa27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 CSHL1Q14406 222 aa27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 NXNL1Q96CM4 212 aa27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 UBXN10Q96LJ8 280 aa27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM202A6NGA9 273 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 QSOX1O00391 747 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 LILRB5O75023 590 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 PROCP04070 461 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 PFN3P60673 137 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC153Q494R4 210 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM47EQ6ZV65 393 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 OTOAQ7RTW8 1153 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 FBXL6Q8N531 539 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCED1AQ9H1Q7 454 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 EPHX3Q9H6B9 360 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRKAB1Q9Y478 270 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 BPGMP07738 259 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 BGNP21810 368 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 NUDT1P36639 197 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF547Q8IVP9 402 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 CPNE9Q8IYJ1 553 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEFF1Q8IYR6 380 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZBTB2Q8N680 514 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 INPP5DQ92835 1189 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 TSNARE1Q96NA8 513 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 PITPNM3Q9BZ71 974 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 SYTL2Q9HCH5 934 aa27.27■■□□□ 1.96
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