RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 OASLQ15646 514 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 MANEAQ5SRI9 462 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 KCTD11Q693B1 232 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM26Q6ZUK4 368 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 FAM129CQ86XR2 697 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 BMPERQ8N8U9 685 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 TTC25Q96NG3 672 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 UCK1Q9HA47 277 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 SMOXQ9NWM0 555 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 KLHL3Q9UH77 587 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 B4E171 279 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 KCNJ13O60928 360 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 IDSP22304 550 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 TSPAN7P41732 249 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 CTSCP53634 463 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 LDLRAP1Q5SW96 308 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 GPRC6AQ5T6X5 926 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 WASH2PQ6VEQ5 465 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 LINC00523Q86TU6 105 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 TRIM48Q8IWZ4 208 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 DDHD1Q8NEL9 900 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 WBP1Q96G27 269 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 DDA1Q9BW61 102 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 EPB41L1Q9H4G0 881 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 WASH6PQ9NQA3 447 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 OGFRQ9NZT2 677 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 KCTD3Q9Y597 815 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 OR52A4PA6NMU1 304 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 STMND1H3BQB6 276 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 TYRP1P17643 537 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 HADHAP40939 763 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 CCNG2Q16589 344 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 AGAP9Q5VTM2 703 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 OR4K2Q8NGD2 314 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF398Q8TD17 642 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 HOMER3Q9NSC5 361 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 POT1Q9NUX5 634 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF148Q9UQR1 794 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 WDR37Q9Y2I8 494 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 ATMQ13315 3056 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 POP7O75817 140 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 AP2A1O95782 977 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 VCLP18206 1134 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 WT1P19544 449 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 FDFT1P37268 417 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 GDF10P55107 478 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 GFERP55789 205 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 C19orf57Q0VDD7 668 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 SPARCL1Q14515 664 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 CLCA4Q14CN2 919 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 ANKS6Q68DC2 871 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 DENND5AQ6IQ26 1287 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM220Q6QAJ8 160 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 C4orf22Q6V702 233 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 TLR10Q9BXR5 811 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 FKBPLQ9UIM3 349 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-201ENST00000378543 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 KLHL33A6NCF5 533 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 OR2AG2A6NM03 316 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 ZSCAN12O43309 604 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 UBXN7O94888 489 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 PRAMEF1O95521 474 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 METTL18O95568 372 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 MC2RQ01718 297 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 DMPKQ09013 629 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 LY6DQ14210 128 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 DCAF12Q5T6F0 453 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 AMZ2Q86W34 360 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 PLXDC1Q8IUK5 500 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 ATG4AQ8WYN0 398 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 NKD1Q969G9 470 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 CXorf40BQ96DE9 158 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 SGF29Q96ES7 293 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 SEMA4CQ9C0C4 833 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 SLC40A1Q9NP59 571 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 JRKLQ9Y4A0 524 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 SRP72O76094 671 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 AMD1P17707 334 aa23.06■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 MSNP26038 577 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 RAB15P59190 212 aa23.06■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 XIAPP98170 497 aa23.06■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 LAMB3Q13751 1172 aa23.06■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF843Q8N446 348 aa23.06■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 OR13C4Q8NGS5 318 aa23.06■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 CTRCQ99895 268 aa23.06■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 ASB8Q9H765 288 aa23.06■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa23.06■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 GAS8O95995 478 aa23.05■■□□□ 1.28
FAAP20-201ENST00000378543 C9P02748 559 aa23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms