RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 PGM3O95394 542 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 CETPP11597 493 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 SAT1P21673 171 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 NR2F2P24468 414 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 RGS19P49795 217 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 TERF1P54274 439 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 TMF1P82094 1093 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 GAGE2BQ13066 116 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 GAGE2EQ4V326 116 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 PDSS1Q5T2R2 415 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 KRT79Q5XKE5 535 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 GAGE2AQ6NT46 116 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 PLXDC2Q6UX71 529 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 SMIM29Q86T20 159 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00346Q8IVM7 164 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 SCML4Q8N228 414 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 TBC1D16Q8TBP0 767 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 JAKMIP2Q96AA8 810 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC22A18Q96BI1 424 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 NEUROD6Q96NK8 337 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 RTN4RQ9BZR6 473 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 PDE7BQ9NP56 450 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 AMACRQ9UHK6 382 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 ICAM5Q9UMF0 924 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 SNX8Q9Y5X2 465 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 DOCK7Q96N67 2140 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A0G2JNG1 304 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 C15orf62A8K5M9 175 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 SYNGR3O43761 229 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 AVILO75366 819 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 BMP10O95393 424 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 IGLV2-11P01706 119 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 CRYAAP02489 173 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 TFAP2AP05549 437 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 LDHCP07864 332 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 BDNFP23560 247 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 MARK3P27448 753 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 MLLT10P55197 1068 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 GAGE5Q13069 117 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 GAGE6Q13070 117 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 KIR2DS5Q14953 304 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 NTRK2Q16620 822 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 SIRPB2Q5JXA9 342 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 GDPD4Q6W3E5 623 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 GALNT5Q7Z7M9 940 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 NFE4Q86UQ8 179 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 DMBX1Q8NFW5 382 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 RDM1Q8NG50 284 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 ABHD8Q96I13 439 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 KIFC3Q9BVG8 833 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNK15Q9H427 330 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 TRPC7Q9HCX4 862 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 ZFP57Q9NU63 452 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 GIMAP4Q9NUV9 329 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 PSD3Q9NYI0 1048 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 TAS2R14Q9NYV8 317 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 HACL1Q9UJ83 578 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 RPS6KA6Q9UK32 745 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 A8MV72 311 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 LMX1BO60663 402 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 CTSVO60911 334 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF432O94892 652 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 GCNT3O95395 438 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 BAG4O95429 457 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 IGHV4-39P01824 125 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 KRT19P08727 400 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 CSF2RAP15509 400 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 NR1D1P20393 614 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 MCCP23508 829 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 HSD17B4P51659 736 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 STAT2P52630 851 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 GRAPQ13588 217 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 KRT33BQ14525 404 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 ACCSLQ4AC99 568 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 IGSF11Q5DX21 431 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 ALS2CLQ60I27 953 aa3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms