RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 LAS2Q8IYD9 372 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ANKS4BQ8N8V4 417 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SETD6Q8TBK2 473 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SAP25Q8TEE9 199 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GANCQ8TET4 914 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM170AQ8WVE7 144 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 HMGB4Q8WW32 186 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TUBGCP3Q96CW5 907 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 MEGF10Q96KG7 1140 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GAL3ST4Q96RP7 486 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SLC22A12Q96S37 553 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 BCL7BQ9BQE9 202 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 KAT14Q9H8E8 782 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 AKTIPQ9H8T0 292 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GORASP2Q9H8Y8 452 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SP140LQ9H930 580 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 KCNMB3Q9NPA1 279 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 C20orf141Q9NUB4 165 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 MKLN1Q9UL63 735 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 NENFQ9UMX5 172 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 U3KQV3 271 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1B0GUA9 196 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 H7C0C1 242 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM24O15164 1050 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CTAGE5O15320 804 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GSC2O15499 205 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SELENOFO60613 162 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 DAB1O75553 588 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ABHD2P08910 425 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 FAM86B2P0C5J1 330 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 FDPSP14324 419 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SDHBP21912 280 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 RPL10P27635 214 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 RBL1P28749 1068 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CDAP32320 146 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 OR1G1P47890 313 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SNU13P55769 128 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PDE1BQ01064 536 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 IKZF1Q13422 519 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PTK6Q13882 451 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GEN1Q17RS7 908 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM196Q5HYL7 178 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SLC30A9Q6PML9 568 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 MFSD7Q6UXD7 560 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PAQR9Q6ZVX9 377 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 REXO1L1PQ8IX06 675 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 AADATQ8N5Z0 425 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 NIPA2Q8N8Q9 360 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SPERTQ8NA61 448 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 FAM46DQ8NEK8 389 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SLC20A1Q8WUM9 679 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 MIB2Q96AX9 1013 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 MIEF2Q96C03 454 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SLC41A3Q96GZ6 507 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 HAPLN3Q96S86 360 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 KIFC3Q9BVG8 833 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC106Q9BWC9 280 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 COX16Q9P0S2 106 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 HSFX1Q9UBD0 423 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 AURKCQ9UQB9 309 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 EVC2Q86UK5 1308 aa2.48□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa2.48□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PPQ1 181 aa2.48□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PS29 197 aa2.48□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SYCE3A1L190 88 aa2.48□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 MAGEB17A8MXT2 336 aa2.48□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 E7ENX8 843 aa2.48□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 HPXP02790 462 aa2.48□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CYBBP04839 570 aa2.48□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GNAI3P08754 354 aa2.48□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TACR2P21452 398 aa2.48□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CPN2P22792 545 aa2.48□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GLRA2P23416 452 aa2.48□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GCSHP23434 173 aa2.48□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GPTP24298 496 aa2.48□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CLDN15P56746 228 aa2.48□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 RWDD2BP57060 319 aa2.48□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC15Q0P6D6 951 aa2.48□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CALCOCO2Q13137 446 aa2.48□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms