RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 ARHGAP17Q68EM7 881 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 DENND5AQ6IQ26 1287 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 TMEM207Q6UWW9 146 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 VN1R5Q7Z5H4 357 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 NT5C3BQ969T7 300 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 ATG4CQ96DT6 458 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 MINDY3Q9H8M7 445 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 INVSQ9Y283 1065 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 PARP14Q460N5 1801 aa21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 AP3D1O14617 1153 aa21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 CACNG3O60359 315 aa21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 FTH1P02794 183 aa21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 IQCF3P0C7M6 154 aa21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 TMEM132DQ14C87 1099 aa21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 KIAA0319Q5VV43 1072 aa21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 ENPP6Q6UWR7 440 aa21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 SPATA19Q7Z5L4 167 aa21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 SPATA22Q8NHS9 363 aa21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 RNF170Q96K19 258 aa21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 RHNO1Q9BSD3 238 aa21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 CDADC1Q9BWV3 514 aa21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 UTS2RQ9UKP6 389 aa21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 SLC22A3O75751 556 aa21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 GJB1P08034 283 aa21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 CLK1P49759 484 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 GPLD1P80108 840 aa21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 CADM2Q8N3J6 435 aa21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 PYCR2Q96C36 320 aa21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 DMRTB1Q96MA1 342 aa21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 DPP3Q9NY33 737 aa21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 AASSQ9UDR5 926 aa21.5■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 OR2A25A4D2G3 310 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 DSCR3O14972 297 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 PSMD3O43242 534 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 FKBP9O95302 570 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 ICAM3P32942 547 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 CYP2C18P33260 490 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 DCTP40126 519 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 SMU1Q2TAY7 513 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 DLEU7Q6UYE1 221 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 TBL1YQ9BQ87 522 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 FAM25AB3EWG3 89 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 FAM25CB3EWG5 89 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 FAM25GB3EWG6 89 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 CDK2AP1O14519 115 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 VPS4BO75351 444 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 ITGAMP11215 1152 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 CLCN5P51795 746 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 GPR50Q13585 617 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 GPR158Q5T848 1215 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 NECAB2Q7Z6G3 386 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 MICU2Q8IYU8 434 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 FAM149B1Q96BN6 582 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 PTERQ96BW5 349 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 TSPAN17Q96FV3 270 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 NPY6RQ99463 290 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 TTYH2Q9BSA4 534 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 BRINP2Q9C0B6 783 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 GORASP2Q9H8Y8 452 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 TRIM39Q9HCM9 518 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 SCN3BQ9NY72 215 aa21.49■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa21.48■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 LRRC14BA6NHZ5 514 aa21.48■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 GNGT2O14610 69 aa21.48■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 GAS2O43903 313 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 MBTD1Q05BQ5 628 aa21.48■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 SEMA3BQ13214 749 aa21.48■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 RFX4Q33E94 735 aa21.48■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 ERAP2Q6P179 960 aa21.48■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 ZNF438Q7Z4V0 828 aa21.48■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 DPP10Q8N608 796 aa21.48■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 SLC38A4Q969I6 547 aa21.48■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 ZFYVE19Q96K21 471 aa21.48■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 WDR70Q9NW82 654 aa21.48■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 STMN3Q9NZ72 180 aa21.48■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 EHD3Q9NZN3 535 aa21.48■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.48■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 A8MV72 311 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 RGS10O43665 173 aa21.48■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 LCKP06239 509 aa21.48■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 PKLRP30613 574 aa21.48■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms