RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 CNTN6Q9UQ52 1028 aa10.21□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 WNT9AO14904 365 aa10.21□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 UGT2B17O75795 530 aa10.21□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 OR4F21O95013 312 aa10.21□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 PRPS2P11908 318 aa10.21□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 UGT1A5P35504 534 aa10.21□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 ACTR1BP42025 376 aa10.21□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 ACTR1AP61163 376 aa10.21□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 MBLAC2Q68D91 279 aa10.21□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 CLEC6AQ6EIG7 209 aa10.21□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 KCTD13Q8WZ19 329 aa10.21□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF354BQ96LW1 612 aa10.21□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 TWNKQ96RR1 684 aa10.21□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 OSBPL11Q9BXB4 747 aa10.21□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa10.21□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 ACSS2Q9NR19 701 aa10.21□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 CMTM6Q9NX76 183 aa10.21□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 NR2E1Q9Y466 385 aa10.21□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 U3KQV3 271 aa10.21□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 FAM86C2PA6NEL3 165 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 KERAO60938 352 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 GDI1P31150 447 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 MASP1P48740 699 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 VEGFBP49765 207 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 MZT2AQ6P582 158 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 C11orf65Q8NCR3 313 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 GSTCDQ8NEC7 633 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 MPP4Q96JB8 637 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 GMLQ99445 158 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 PIGVQ9NUD9 493 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 GALNT8Q9NY28 637 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 CNTN3Q9P232 1028 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 H7C0S8 307 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 ALPPL2P10696 532 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 FSHRP23945 695 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 GPR17Q13304 367 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 TAB1Q15750 504 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 VPS26BQ4G0F5 336 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 TMC8Q8IU68 726 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 KBTBD2Q8IY47 623 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF461Q8TAF7 563 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 DNASE1L2Q92874 299 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 KLK6Q92876 244 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 SIPA1Q96FS4 1042 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 C12orf66Q96MD2 445 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 AGAP2Q99490 1192 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 SRMSQ9H3Y6 488 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 MATN4O95460 622 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 GJA1P17302 382 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 HNMTP50135 292 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF792Q3KQV3 632 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 SNX20Q7Z614 316 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 OR10H5Q8NGA6 315 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 OR2AG1Q9H205 316 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 CCSER2Q9H7U1 834 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 NECTIN3Q9NQS3 549 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 ARL8BQ9NVJ2 186 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 OGDHLQ9ULD0 1010 aa10.2□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 ELOVL7A1L3X0 281 aa10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 METTL18O95568 372 aa10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 ECDO95905 644 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 STAT5AP42229 794 aa10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 CDK9P50750 372 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 RPTNQ6XPR3 784 aa10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 TDRPQ86YL5 185 aa10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 ESAMQ96AP7 390 aa10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 SLC47A1Q96FL8 570 aa10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 EPB41L1Q9H4G0 881 aa10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 GDAP2Q9NXN4 497 aa10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 WWP2O00308 870 aa10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 SCAMP1O15126 338 aa10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 SAGP10523 405 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 DGKEP52429 567 aa10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 GDF10P55107 478 aa10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 SLC10A7Q0GE19 358 aa10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 ATP1A4Q13733 1029 aa10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 PDK3Q15120 406 aa10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 LRRC73Q5JTD7 316 aa10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 PQLC1Q8N2U9 271 aa10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 CNTD1Q8N815 330 aa10.19□□□□□ -0.78
ZNF548-202ENST00000366197 SLC35B2Q8TB61 432 aa10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms