RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM198Q66K66 360 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM180BQ6P0A1 224 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 TPRG1Q6ZUI0 275 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANO5Q75V66 913 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 GALNT13Q8IUC8 556 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDTC1Q8N5D0 677 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 TEX19Q8NA77 164 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD52Q8NB46 1076 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP6NLQ92738 828 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PGAM5Q96HS1 289 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDOQ99489 341 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 GFI1Q99684 422 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLX1AQ9BQ83 275 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC38A7Q9NVC3 462 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 OGFRQ9NZT2 677 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXL17Q9UF56 701 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 CMAHPQ9Y471 501 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLIC2O15247 247 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 TPPPO94811 219 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2C1O95371 312 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 GH2P01242 217 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PATE4P0C8F1 98 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 GABRB1P18505 474 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 GNAZP19086 355 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PAX3P23760 479 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PON1P27169 355 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 TM4SF1P30408 202 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 HILS1P60008 231 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLEC17AQ6ZS10 378 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF534Q76KX8 674 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHST9Q7L1S5 443 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 GALNT5Q7Z7M9 940 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTOV1Q86YD1 416 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 CEP97Q8IW35 865 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDSUB1Q8N9V3 476 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMPDL3BQ92485 455 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 FSD1Q9BTV5 496 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 HGH1Q9BTY7 390 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 BARHL1Q9BZE3 327 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZHX3Q9H4I2 956 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAJC18Q9H819 358 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC52A3Q9NQ40 469 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSPYL4Q9UJ04 414 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACAD8Q9UKU7 415 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 NENFQ9UMX5 172 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMCHD1A6NHR9 2005 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A0G2JLW4 131 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2M5A3KFT3 312 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 BAIAP3O94812 1187 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SELLP14151 372 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 MSH3P20585 1137 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAPK4P31152 587 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSD17B4P51659 736 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARF1P84077 181 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 GAGE2BQ13066 116 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM30BQ3MIR4 351 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 GAGE2EQ4V326 116 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGAP17Q68EM7 881 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 GAGE2AQ6NT46 116 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCYL3Q8IZE3 742 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAS1R2Q8TE23 839 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 FCAMRQ8WWV6 532 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 LGALS12Q96DT0 336 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 LITAFQ99732 161 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSD2Q9BQI7 771 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PAG1Q9NWQ8 432 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADPRHL2Q9NX46 363 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 MIOSQ9NXC5 875 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 GAGE2DQ9UEU5 116 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYSRT1A8MQ03 144 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDRT15L2A8MXV6 281 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 AP3D1O14617 1153 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDUFS4O43181 175 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR137BO60478 399 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 GCNT3O95395 438 aa2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms