RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 PLD3Q8IV08 490 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 ABI1Q8IZP0 508 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 LPPQ93052 612 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 EXT2Q93063 718 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 ALG9Q9H6U8 611 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 ZNF221Q9UK13 617 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 STAP1Q9ULZ2 295 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 AREL1O15033 823 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 CELF2O95319 508 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 CTSHP09668 335 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 ACOX1Q15067 660 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 ZNF181Q2M3W8 571 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 ZNF789Q5FWF6 425 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 TXNDC11Q6PKC3 985 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 SPATC1Q76KD6 591 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 PNPLA1Q8N8W4 532 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 ANKRD49Q8WVL7 239 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 RDH12Q96NR8 316 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 KCNA7Q96RP8 456 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 ULBP1Q9BZM6 244 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 ERVK-18Q9QC07 812 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 BTRCQ9Y297 605 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 PTTG1O95997 202 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 RBP1P09455 135 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 HTR1EP28566 365 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 KCNC1P48547 511 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 KRT6CP48668 564 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 RPL34P49207 117 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 KCNK10P57789 538 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 SELPLGQ14242 412 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 UNC50Q53HI1 259 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 PCID2Q5JVF3 399 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 OTOP3Q7RTS5 596 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 PROSER1Q86XN7 944 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 IQCF2Q8IXL9 164 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 SUN5Q8TC36 379 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 PROX1Q92786 737 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 TMEM30AQ9NV96 361 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 NUDT5Q9UKK9 219 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 FBXO5Q9UKT4 447 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 ALX3O95076 343 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 NDST3O95803 873 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 C1RP00736 705 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 JCHAINP01591 159 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 LINC00032P0C843 101 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 RAP2AP10114 183 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 LBPP18428 481 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 CLCNKBP51801 687 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 MAP2K5Q13163 448 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 LAPTM5Q13571 262 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 SULT1C3Q6IMI6 304 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 FKBP9P1Q75LS8 142 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 ITFG1Q8TB96 612 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 SHROOM3Q8TF72 1996 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 MID1IP1Q9NPA3 183 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 SNX10Q9Y5X0 201 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 C17orf102A2RUQ5 167 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 YJEFN3A6XGL0 299 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 TBKBP1A7MCY6 615 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 CCRL2O00421 344 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 TULP3O75386 442 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 CDK14O94921 469 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 PARNO95453 639 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 ACVR2AP27037 513 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 ATAD3CQ5T2N8 411 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 DTWD1Q8N5C7 304 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 SPATA22Q8NHS9 363 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 LGALS12Q96DT0 336 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 GAD1Q99259 594 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 NPY6RQ99463 290 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 TUBB1Q9H4B7 451 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 CRTAC1Q9NQ79 661 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 POLG2Q9UHN1 485 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 BOLA1Q9Y3E2 137 aa16.61■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa16.6■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 FAM92AA1XBS5 289 aa16.6■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 MYBPHLA2RUH7 354 aa16.6■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 CCDC154A6NI56 674 aa16.6■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 SAGE2PA6NJ88 616 aa16.6■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 I6L893 689 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 CD6P30203 668 aa16.6■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 PPP2R2BQ00005 443 aa16.6■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 EPS8Q12929 822 aa16.6■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 RCAN2Q14206 197 aa16.6■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 XKR4Q5GH76 650 aa16.6■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 WDR45BQ5MNZ6 344 aa16.6■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 PRSS48Q7RTY5 328 aa16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms