RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 PRKAR1AP10644 381 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 IGFBP5P24593 272 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 PGDP52209 483 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 SP2Q02086 613 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 CLEC4CQ8WTT0 213 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 RNF31Q96EP0 1072 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 SLC38A3Q99624 504 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC72A6NJI9 287 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 TNFRSF11BO00300 401 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 CROCCP3Q8IVE0 287 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 DHRS7Q9Y394 339 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 ARL5AQ9Y689 179 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 A8MUI8 341 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 LGR5O75473 907 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 LILRA4P59901 499 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 CHIT1Q13231 466 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF846Q147U1 533 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 UBXN2BQ14CS0 331 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF662Q6ZS27 426 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 PEX5LQ8IYB4 626 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 FAM47BQ8NA70 645 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 TRMOQ9BU70 441 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 TRPS1Q9UHF7 1281 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 FZD10Q9ULW2 581 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PQ67 120 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 CLDN4O14493 209 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 PRKCGP05129 697 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 LAPTM5Q13571 262 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 FAM81AQ8TBF8 368 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 COL6A1P12109 1028 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 KCNA5P22460 613 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 ASMTP46597 345 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 STARP49675 285 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 NRLP54845 237 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 TSC22D1Q15714 1073 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 SNX20Q7Z614 316 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 HDDC3Q8N4P3 179 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 CIB1Q99828 191 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 TPK1Q9H3S4 243 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 IL12BP29460 328 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 ACTR3P61158 418 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 IL18R1Q13478 541 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 FBXO42Q6P3S6 717 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 RASGEF1CQ8N431 466 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 PLGRKTQ9HBL7 147 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 CKLFQ9UBR5 152 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 PSMD9O00233 223 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 OR4F21O95013 312 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D21Q8IYX1 336 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 TNFRSF25Q93038 417 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 ESAMQ96AP7 390 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 PLD4Q96BZ4 506 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A51Q9H1U9 297 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 RLN1P04808 185 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC17Q8N6Y2 441 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 TFAP2BQ92481 460 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 SRMSQ9H3Y6 488 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 KCND1Q9NSA2 647 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 SAP18O00422 153 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 C8AP07357 584 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 UROSP10746 265 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 MAGP20916 626 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 IL18Q14116 193 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 TMC8Q8IU68 726 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 CRYBG2Q8N1P7 616 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 TGDSO95455 350 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 MARCH7Q9H992 704 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 DNAJC28Q9NX36 388 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 SLC35G6P0C7Q6 338 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 CCR10P46092 362 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM39Q9HCM9 518 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHGC3Q9UN70 934 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 HKDC1Q2TB90 917 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 XKR4Q5GH76 650 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 SULT1C3Q6IMI6 304 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 NMUR2Q9GZQ4 415 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 IRAK3Q9Y616 596 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 A0A075B6Q4 140 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 FAM149AA5PLN7 773 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 AP2A2O94973 939 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 PBX3P40426 434 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 SLC13A2Q13183 592 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 PAOXQ6QHF9 649 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa22.13■■□□□ 1.13
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