RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301730.12

RNPS1-201, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RNPS1, Length 1,276 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-201ENST00000301730 APC2O95996 2303 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 KLHL33A6NCF5 533 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 ZW10O43264 779 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 AVILO75366 819 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 MLNP12872 115 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 NMBRP28336 390 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 PAFAH1B1P43034 410 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 PTGIRP43119 386 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 PRAMEP78395 509 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 ITIH4Q14624 930 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 RTP5Q14D33 572 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 KIF26BQ2KJY2 2108 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 XKR5Q6UX68 686 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 PACS1Q6VY07 963 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 NAT8LQ8N9F0 302 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 AVL9Q8NBF6 648 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 OR6P1Q8NGX9 317 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 OR4L1Q8NH43 312 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.848e-7■■■■■ 31.2
RNPS1-201ENST00000301730 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 SOX13Q9UN79 622 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 WDR37Q9Y2I8 494 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 CCDC188H7C350 402 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 CD1CP29017 333 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 CASQ1P31415 396 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 SLC19A1P41440 591 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 CLCA4Q14CN2 919 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 AMZ1Q400G9 498 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 ARMC3Q5W041 872 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 METRNLQ641Q3 311 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 SYT10Q6XYQ8 523 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 KLHL7Q8IXQ5 586 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 CLDN19Q8N6F1 224 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 MDM1Q8TC05 714 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 SH3KBP1Q96B97 665 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 SERPINB12Q96P63 405 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 SLC38A3Q99624 504 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 RDH14Q9HBH5 336 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 KCNK4Q9NYG8 393 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 DKK4Q9UBT3 224 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 ASIC3Q9UHC3 531 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 ACACAQ13085 2346 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-201ENST00000301730 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 OR52A4PA6NMU1 304 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 GOLGA8MH3BSY2 632 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 CPNE6O95741 557 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 NSG1P42857 185 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 MAGEA3P43357 314 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 GPLD1P80108 840 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 CYP4F3Q08477 520 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 SEMA3AQ14563 771 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 MAP9Q49MG5 647 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 SLITRK4Q8IW52 837 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 PPIL6Q8IXY8 311 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 MPP5Q8N3R9 675 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 HM13Q8TCT9 377 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 MFSD3Q96ES6 412 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 RUNDC3BQ96NL0 473 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 TMEM74Q96NL1 305 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 NUDT22Q9BRQ3 303 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 FOXP3Q9BZS1 431 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 POT1Q9NUX5 634 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 FAM8A1Q9UBU6 413 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 PRSS21Q9Y6M0 314 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 LILRA5A6NI73 299 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 AP2A2O94973 939 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 VIPP01282 170 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 ARNTP27540 789 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 CCKBRP32239 447 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 CSF2RBP32927 897 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 HALP42357 657 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 EPHA4P54764 986 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 INHBCP55103 352 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 DR1Q01658 176 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 SQSTM1Q13501 440 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 NKAIN2Q5VXU1 208 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 CES3Q6UWW8 571 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 CERS6Q6ZMG9 384 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 USP53Q70EK8 1073 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 PIM3Q86V86 326 aa20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms