RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 TLE2Q04725 743 aa18.98■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 NFATC2Q13469 925 aa18.98■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 GTF2H2Q13888 395 aa18.98■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 TRIM60Q495X7 471 aa18.98■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 TIGD2Q4W5G0 525 aa18.98■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 LCN8Q6JVE9 175 aa18.98■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa18.98■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 Q6ZSR9 355 aa18.98■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 ERMP1Q7Z2K6 904 aa18.98■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa18.98■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 SNX20Q7Z614 316 aa18.98■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 AQP12AQ8IXF9 295 aa18.98■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 FAM217AQ8IXS0 508 aa18.98■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 RBFAQ8N0V3 343 aa18.98■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 HBEGFQ99075 208 aa18.98■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 SLC2A11Q9BYW1 496 aa18.98■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 TNKS2Q9H2K2 1166 aa18.98■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 CLEC4EQ9ULY5 219 aa18.98■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 DHRS12A0PJE2 317 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 A8MX80 341 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 OR7A17O14581 309 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 ARPC2O15144 300 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 FFAR2O15552 330 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 TRIM16O95361 564 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 GUCA1CO95843 209 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 CNPP09543 421 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 PSMC3P17980 439 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 UGT1A6P19224 532 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 ITGALP20701 1170 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 UGT1A1P22309 533 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 UGT1A4P22310 534 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 UGT1A3P35503 534 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 UGT1A5P35504 534 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 HNF1BP35680 557 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 INPP5AQ14642 412 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 FUT11Q495W5 492 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 RABL3Q5HYI8 236 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 TBCELQ5QJ74 424 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 IL27RAQ6UWB1 636 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 TPGS1Q6ZTW0 290 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 ITIH5Q86UX2 942 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 SFRP1Q8N474 314 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 TMEM199Q8N511 208 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 CLDN19Q8N6F1 224 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 CCT7Q99832 543 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 C17orf80Q9BSJ5 609 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 ZNF696Q9H7X3 374 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 IL26Q9NPH9 171 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 ZIM2Q9NZV7 527 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 ACTR3BQ9P1U1 418 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 SUN2Q9UH99 717 aa18.97■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 RAD51BO15315 384 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 KATNA1O75449 491 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 GABRR2P28476 465 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 GSTT1P30711 240 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 LMAN2Q12907 356 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 IFNEQ86WN2 208 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 MYO1HQ8N1T3 1032 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 ANKFN1Q8N957 763 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 OR4F6Q8NGB9 312 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 CFAP97Q9P2B7 532 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 FAM234BA2RU67 622 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 CLPTM1O96005 669 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 CKMP06732 381 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 BPIP17213 487 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 CKMT2P17540 419 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 ACRV1P26436 265 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 CA8P35219 290 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 HSPA7P48741 367 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 RGS4P49798 205 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 GSK3BP49841 420 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 BBS7Q8IWZ6 715 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 GALNT15Q8N3T1 639 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 VWCEQ96DN2 955 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 APOL5Q9BWW9 433 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 OSBPL11Q9BXB4 747 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 ALG2Q9H553 416 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 SPG21Q9NZD8 308 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 SLAMF8Q9P0V8 285 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 CRLS1Q9UJA2 301 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 ST14Q9Y5Y6 855 aa18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
USP21-201ENST00000289865 TEX28O15482 410 aa18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms