RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278833.3

ROM1-201, Transcript of retinal outer segment membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ROM1, Length 1,878 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1-201ENST00000278833 SLC8A2Q9UPR5 921 aa24.75■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 ADAM12O43184 909 aa24.75■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 OR1I1O60431 355 aa24.75■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 BMP10O95393 424 aa24.75■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 SYN1P17600 705 aa24.75■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 ECT2LQ008S8 904 aa24.75■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 EMX2Q04743 252 aa24.75■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 SMU1Q2TAY7 513 aa24.75■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 TMEM259Q4ZIN3 620 aa24.75■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa24.75■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 KRT80Q6KB66 452 aa24.75■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 PROSER1Q86XN7 944 aa24.75■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 SPPL2CQ8IUH8 684 aa24.75■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 CPNE9Q8IYJ1 553 aa24.75■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 MYO1HQ8N1T3 1032 aa24.75■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 TNIP2Q8NFZ5 429 aa24.75■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 HIPK3Q9H422 1215 aa24.75■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 IL1RL2Q9HB29 575 aa24.75■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 CD320Q9NPF0 282 aa24.75■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 CD274Q9NZQ7 290 aa24.75■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 HCSTQ9UBK5 93 aa24.75■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 SUN2Q9UH99 717 aa24.75■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 ZNF711Q9Y462 761 aa24.75■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 COL4A6Q14031 1691 aa24.74■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 GFRA2O00451 464 aa24.74■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 KIAA0355O15063 1070 aa24.74■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 RASAL1O95294 804 aa24.74■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 ATP6V1B1P15313 513 aa24.74■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 CKMT2P17540 419 aa24.74■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 CHRM3P20309 590 aa24.74■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 HMGCLP35914 325 aa24.74■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 AP1S1P61966 158 aa24.74■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 TBC1D21Q8IYX1 336 aa24.74■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 FIBCD1Q8N539 461 aa24.74■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 TEX37Q96LM6 180 aa24.74■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 PDLIM1O00151 329 aa24.73■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 PITPNM1O00562 1244 aa24.73■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 RFC2P35250 354 aa24.73■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 LIPEQ05469 1076 aa24.73■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 PAGE3Q5JUK9 113 aa24.73■■□□□ 1.55
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ROM1-201ENST00000278833 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa24.73■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 MUC3BQ9H195 1237 aa24.73■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa24.73■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 ZNF639Q9UID6 485 aa24.73■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 PKP3Q9Y446 797 aa24.73■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 OR51B4Q9Y5P0 310 aa24.73■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 CEPT1Q9Y6K0 416 aa24.73■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 E5RI56 91 aa24.72■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 C1RP00736 705 aa24.72■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 MSH3P20585 1137 aa24.72■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 ERVPABLB-1P60509 514 aa24.72■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 UFM1P61960 85 aa24.72■■□□□ 1.55
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ROM1-201ENST00000278833 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa24.72■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 Q6ZSR9 355 aa24.72■■□□□ 1.55
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ROM1-201ENST00000278833 ABLIM3O94929 683 aa24.72■■□□□ 1.55
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ROM1-201ENST00000278833 TPGS2Q68CL5 300 aa24.72■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 SBSNQ6UWP8 590 aa24.72■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 CBR4Q8N4T8 237 aa24.72■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 EFHBQ8N7U6 833 aa24.72■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 PROKR1Q8TCW9 393 aa24.72■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 SMIM14Q96QK8 99 aa24.72■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 EGFL7Q9UHF1 273 aa24.72■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 ANAPC2Q9UJX6 822 aa24.72■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 AK5Q9Y6K8 562 aa24.72■■□□□ 1.55
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ROM1-201ENST00000278833 ACOX3O15254 700 aa24.71■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 IL12AP29459 219 aa24.71■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 SLC36A3Q495N2 470 aa24.71■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 HID1Q8IV36 788 aa24.71■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 MPP4Q96JB8 637 aa24.71■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 ADI1Q9BV57 179 aa24.71■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 LRRC3Q9BY71 257 aa24.71■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 AURKCQ9UQB9 309 aa24.71■■□□□ 1.55
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ROM1-201ENST00000278833 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa24.71■■□□□ 1.55
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ROM1-201ENST00000278833 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa24.7■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 TIMP1P01033 207 aa24.7■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 OXTRP30559 389 aa24.7■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 LETMD1Q6P1Q0 360 aa24.7■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 DCAF4L2Q8NA75 395 aa24.7■■□□□ 1.55
ROM1-201ENST00000278833 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
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