RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243103.3

HOXC12-201, Transcript of homeobox C12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC12, Length 3,335 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12-201ENST00000243103 PPP5CP53041 499 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 SMARCB1Q12824 385 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 BTBD16Q32M84 506 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 GCNT7Q6ZNI0 430 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 TMEM126BQ8IUX1 230 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 HCAR2Q8TDS4 363 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 RIT1Q92963 219 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 CASS4Q9NQ75 786 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 MAU2Q9Y6X3 613 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 ARHGEF9O43307 516 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 ALX3O95076 343 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 SULT1E1P49888 294 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 SLC26A2P50443 739 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 TUBA1BP68363 451 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 SELPLGQ14242 412 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 PTPRCAPQ14761 206 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 TUBA1AQ71U36 451 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 NLRP8Q86W28 1048 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 PHACTR4Q8IZ21 702 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 TTC39CQ8N584 583 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 SLC2A14Q8TDB8 520 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 PYCR2Q96C36 320 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 ZFP42Q96MM3 310 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 TMEM181Q9P2C4 612 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 DNMT3LQ9UJW3 386 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 CCDC162PA2VCL2 907 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 TBKBP1A7MCY6 615 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 MED26O95402 600 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 PWP1Q13610 501 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 TMEM132DQ14C87 1099 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 PARP16Q8N5Y8 322 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 OR10A6Q8NH74 314 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 RNF39Q9H2S5 420 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 SLAMF7Q9NQ25 335 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 FAM118AQ9NWS6 357 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 KIF17Q9P2E2 1029 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 MPOP05164 745 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 GADD45AP24522 165 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 OR3A3P47888 321 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 CASP9P55211 416 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 ZNF404Q494X3 552 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 FAM160B1Q5W0V3 765 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 ATG16L2Q8NAA4 619 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 MYRFLQ96LU7 910 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 OR51E2Q9H255 320 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 A0A0X1KG70 313 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 A0A1B0GTL3 188 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 FAM172BPA6NC97 362 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 M0QX08 132 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 NFKBIEO00221 500 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 BCKDKO14874 412 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 MAPK12P53778 367 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 FNDC5Q8NAU1 212 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 RHOXF1Q8NHV9 184 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 POF1BQ8WVV4 589 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 FAM50BQ9Y247 325 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 MEIS3P2A8K0S8 358 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 A8MT66 165 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 FAM189BP81408 668 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 CLCA4Q14CN2 919 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 TAZQ16635 292 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 TTC30BQ8N4P2 665 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 AS3MTQ9HBK9 375 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 CD300AQ9UGN4 299 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 MID2Q9UJV3 735 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 TTC34A8MYJ7 566 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 BTN3A3O00478 584 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 RAB10P61026 200 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 IL18R1Q13478 541 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 INSCQ1MX18 579 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 SOWAHAQ2M3V2 549 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 TSTD2Q5T7W7 516 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 DCAF15Q66K64 600 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 GPR153Q6NV75 609 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 MPZL3Q6UWV2 235 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 TLK2Q86UE8 772 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC12-201ENST00000243103 ANKRD46Q86W74 232 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms