RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 MCOLN3Q8TDD5 553 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ACTRT2Q8TDY3 377 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 SORT1Q99523 831 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 HEPHQ9BQS7 1158 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ZBP1Q9H171 429 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 PARVBQ9HBI1 364 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 KCTD5Q9NXV2 234 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 SPO11Q9Y5K1 396 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TBC1D3EA0A087X179 549 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TBC1D3LB9A6J9 549 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 GSTA4O15217 222 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 NIPSNAP2O75323 286 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 PEX11BO96011 259 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 OTCP00480 354 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 KRT6AP02538 564 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 KRT6BP04259 564 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 MMP2P08253 660 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TBC1D3HP0C7X1 549 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 MSL3P1P0C860 447 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 KRT6CP48668 564 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 CLCN4P51793 760 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 CDKN2DP55273 166 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 INPP5AQ14642 412 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 HERC3Q15034 1050 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 PLCL1Q15111 1095 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 SHHQ15465 462 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 CACHD1Q5VU97 1274 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 C22orf39Q6P5X5 142 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 AAGABQ6PD74 315 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 FRMD7Q6ZUT3 714 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 Q7L0L9 218 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 RTL10Q7L3V2 364 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TREML1Q86YW5 311 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 FAM9CQ8IZT9 166 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 CCT7Q99832 543 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 SLC39A3Q9BRY0 314 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ACTR8Q9H981 624 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 IGSF5Q9NSI5 407 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 GULP1Q9UBP9 304 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 NDUFAF1Q9Y375 327 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ATP6AP2O75787 350 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 KRT36O76013 467 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 MYO1DO94832 1006 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 T-ENOLP0DO92 83 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 CD1DP15813 335 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 NSG1P42857 185 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 PGGT1BP53609 377 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 NME5P56597 212 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM154Q6P9G4 183 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 DSG4Q86SJ6 1040 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ZBTB2Q8N680 514 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ACOX2Q99424 681 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 PDFQ9HBH1 243 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 CA14Q9ULX7 337 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 HGFP14210 728 aa10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 HMGCLP35914 325 aa10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 RGRP47804 291 aa10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 PTPN5P54829 565 aa10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ARF5P84085 180 aa10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 UBE3AQ05086 875 aa10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ACOX1Q15067 660 aa10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 SGO1Q5FBB7 561 aa10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 CLEC6AQ6EIG7 209 aa10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ZFP1Q6P2D0 407 aa10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TPRG1Q6ZUI0 275 aa10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 APCDD1Q8J025 514 aa10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 FBXW8Q8N3Y1 598 aa10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 FNDC5Q8NAU1 212 aa10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TWIST2Q8WVJ9 160 aa10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 HMGB4Q8WW32 186 aa10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM159Q96B96 161 aa10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 IL1RL2Q9HB29 575 aa10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ARL15Q9NXU5 204 aa10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TRIM43BA6NCK2 446 aa10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 LAMTOR5O43504 91 aa10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 VNN2O95498 520 aa10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 NFATC1O95644 943 aa10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ASLP04424 464 aa10.49□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 RHOP08100 348 aa10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms