RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233084.7

DDX1-201, Transcript of DEAD-box helicase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DDX1, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1-201ENST00000233084 PIP5K1BO14986 540 aa15.61■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 HGFP14210 728 aa15.61■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 NFKB1P19838 968 aa15.61■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 FOXA1P55317 472 aa15.61■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 OR2B6P58173 313 aa15.61■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 DNAJB13P59910 316 aa15.61■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 PLIN5Q00G26 463 aa15.61■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 ZNF181Q2M3W8 571 aa15.61■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 SPESP1Q6UW49 350 aa15.61■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 LINC00299Q6ZSB3 139 aa15.61■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 IL17RDQ8NFM7 739 aa15.61■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 FRS2Q8WU20 508 aa15.61■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 TEX37Q96LM6 180 aa15.61■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 AKT3Q9Y243 479 aa15.61■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa15.61■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 GNGT2O14610 69 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 LINC00032P0C843 101 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 UMPSP11172 480 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 CST5P28325 142 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 NXNL2Q5VZ03 156 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 BEND5Q7L4P6 421 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 KDELC2Q7Z4H8 507 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 RNF139Q8WU17 664 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 BHMTQ93088 406 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 NACC2Q96BF6 587 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 HPDLQ96IR7 371 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 PPP1R16BQ96T49 567 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 GSTO2Q9H4Y5 243 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 MINDY3Q9H8M7 445 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 H0Y626 953 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 ERVH48-1M5A8F1 160 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 TRIM16O95361 564 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 DBTP11182 482 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 CYP2C18P33260 490 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 GRK3P35626 688 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 SLC1A2P43004 574 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 EFNA5P52803 228 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 IL1RL1Q01638 556 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 SELPLGQ14242 412 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 NPTX1Q15818 432 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 KCNA10Q16322 511 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 TECRLQ5HYJ1 363 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 ARHGAP17Q68EM7 881 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 FAM86B1Q8N7N1 296 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 IGSF5Q9NSI5 407 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 UTS2RQ9UKP6 389 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 U3KQV3 271 aa15.6■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 ZNF487B1APH4 448 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 TREHO43280 583 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 PTTG1O95997 202 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 ASGR1P07306 291 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 IQCF3P0C7M6 154 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 ISL1P61371 349 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 EPS8Q12929 822 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 ZNF470Q6ECI4 717 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 MICU2Q8IYU8 434 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 BEST2Q8NFU1 509 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 ITFG1Q8TB96 612 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 YIPF6Q96EC8 236 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 NFKBIZQ9BYH8 718 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 DCSTAMPQ9H295 470 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 OPTCQ9UBM4 332 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 A0A087WZ62 844 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 LACTBL1A8MY62 500 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 EFCAB9A8MZ26 197 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 MEN1O00255 615 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 B4GALT4O60513 344 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 ANGPTL1O95841 491 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 FTH1P02794 183 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 ACADSBP45954 432 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 CLK1P49759 484 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 SH3BP2P78314 561 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 MBTD1Q05BQ5 628 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 CLCA4Q14CN2 919 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 LHX8Q68G74 356 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 RIMKLAQ8IXN7 391 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 FBXO30Q8TB52 745 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 UBXN10Q96LJ8 280 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 SNX18Q96RF0 628 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 NT5C1AQ9BXI3 368 aa15.59■□□□□ 0.09
DDX1-201ENST00000233084 TRIM54Q9BYV2 358 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms