RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000079702.3

Cbx1-202, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-202ENSMUST00000079702 A0A1Y7VP24 259 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Zfp352A2AML7 551 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Skint11A7XV14 364 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gbp11A9YVJ5 442 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Kpna3O35344 521 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tnfrsf17O88472 185 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 PlgP20918 812 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Slc2a3P32037 493 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ephx2P34914 554 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Asgr1P34927 284 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cct8P42932 548 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tex52Q3TTI8 308 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rnf224Q3UIW8 156 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ubtfl1Q3USZ2 394 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Sult1d1Q3UZZ6 295 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ndufaf2Q59J78 168 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr464Q5SW48 313 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Map3k3Q61084 626 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 VclQ64727 1066 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fam126aQ6P9N1 521 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm7247Q6UY52 187 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Nemp1Q6ZQE4 437 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 LnpkQ7TQ95 425 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr1152Q7TR34 310 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Wdr48Q8BH57 676 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Klhl7Q8BUL5 586 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 C1qtnf7Q8BVD7 289 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Q8C3I9 435 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Zfp62Q8C827 914 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Retreg1dQ8VE91 480 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pcdha5Q91Y15 934 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ucn3Q924A4 164 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Nudt21Q9CQF3 227 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rexo2Q9D8S4 237 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mfsd2aQ9DA75 534 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 RalbQ9JIW9 206 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Plscr1Q9JJ00 328 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Opn4Q9QXZ9 521 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dcun1d1Q9QZ73 259 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 H2afb2S4R1M3 115 aa11.89□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tet2Q4JK59 1912 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tcrg-V3A0A0G2JEW2 117 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm29797A0A140LIA7 188 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ccdc163A2AGD7 326 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tgm7A2ART8 616 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Zbed6D2EAC2 980 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm4969D3YZT1 566 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ppp1r36D3Z0R2 411 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tada2bD3Z4Z0 420 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Il4i1O09046 630 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Foxd2O35392 492 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 MaffO54791 156 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Klc2O88448 599 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tgfb3P17125 410 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 HmgclP38060 325 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 ApodP51910 189 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Kpna2P52293 529 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fbxo40P62932 710 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Trim43bP86448 445 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ttyh2Q3TH73 532 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Slc30a10Q3UVU3 470 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Trim25Q61510 634 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Nlrp4fQ66X05 959 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cand1Q6ZQ38 1230 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ppp2r1bQ7TNP2 601 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Arhgef38Q80VK6 770 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Chil6Q80W26 440 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fzd10Q8BKG4 582 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mrpl22Q8BU88 206 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dnali1Q8BVN8 258 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 4921511C20RikQ8BVT7 469 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Nmur2Q8BZ39 395 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Vps37bQ8R0J7 285 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gtf2h3Q8VD76 309 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gpn2Q8VEJ1 310 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pcdhb21Q91V48 774 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pycr2Q922Q4 320 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tcf7l2Q924A0 459 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tas1r2Q925I4 843 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mrps18aQ99N85 196 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 StambpQ9CQ26 424 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rabl3Q9D4V7 236 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Phf10Q9D8M7 497 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Bpifa3Q9D9J8 232 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dennd6bQ9D9V7 585 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cmtm7Q9ESD6 167 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 MioxQ9QXN5 285 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dnajb8Q9QYI7 227 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mrpl40Q9Z2Q5 206 aa11.88□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm3952A0A0A6YXJ1 191 aa11.87□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr271-ps1A0A1L1SQH2 283 aa11.87□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fam171a2A2A699 822 aa11.87□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Grin3aA2AIR5 1135 aa11.87□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Nt5c1aA3KFX0 365 aa11.87□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Zc3h7aE9PWW6 970 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 SmgcF6VRN1 385 aa11.87□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 NelfeP19426 375 aa11.87□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 HmbsP22907 361 aa11.87□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mmp13P33435 472 aa11.87□□□□□ -0.51
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Defa-rs7P50715 91 aa11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35 ms