RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc2a3P32037 493 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tex52Q3TTI8 308 aa22.37■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nlrp4fQ66X05 959 aa22.37■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tspyl5Q69ZB3 406 aa22.37■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn2r26Q6TAC4 855 aa22.37■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smpd4Q6ZPR5 823 aa22.37■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr1152Q7TR34 310 aa22.37■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Etf1Q8BWY3 437 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpr21Q8BX79 349 aa22.37■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vps37bQ8R0J7 285 aa22.37■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pcdha5Q91Y15 934 aa22.37■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rpe65Q91ZQ5 533 aa22.37■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cpt1bQ924X2 772 aa22.37■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atad3Q925I1 591 aa22.37■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tssk3Q9D2E1 268 aa22.37■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpn3Q9D3W4 284 aa22.37■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ecel1Q9JMI0 775 aa22.37■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plxnb1Q8CJH3 2119 aa22.37■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm35911A0A1D5RLS7 214 aa22.36■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Grin3aA2AIR5 1135 aa22.36■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 6330409D20RikA2AK85 162 aa22.36■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zbed6D2EAC2 980 aa22.36■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm4969D3YZT1 566 aa22.36■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn2r45L7N2B5 852 aa22.36■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc2a7P0C6A1 513 aa22.36■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dlx5P70396 289 aa22.36■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Defb23Q30KP0 166 aa22.36■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Garnl3Q3V0G7 1038 aa22.36■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dyrk2Q5U4C9 599 aa22.36■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MuskQ61006 868 aa22.36■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Avl9Q80U56 649 aa22.36■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sass6Q80UK7 654 aa22.36■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sema3dQ8BH34 777 aa22.36■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MaobQ8BW75 520 aa22.36■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nmur2Q8BZ39 395 aa22.36■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Shisa7Q8C3Q5 558 aa22.36■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Yipf4Q8C407 246 aa22.36■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TardbpQ921F2 414 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TfQ921I1 697 aa22.36■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 LsrQ99KG5 594 aa22.36■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nkx6-1Q99MA9 365 aa22.36■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Det1Q9D0A0 550 aa22.36■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Apba1B2RUJ5 842 aa22.35■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm5795E9PZN8 263 aa22.35■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kcnn4O89109 425 aa22.35■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Acvr1P37172 509 aa22.35■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cd9P40240 226 aa22.35■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Grb7Q03160 535 aa22.35■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 McuQ3UMR5 350 aa22.35■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sult1d1Q3UZZ6 295 aa22.35■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ddrgk1Q80WW9 315 aa22.35■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hs3st3a1Q8BKN6 393 aa22.35■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr394Q8VGR5 310 aa22.35■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wdr73Q9CWR1 371 aa22.35■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mphosph6Q9D1Q1 161 aa22.35■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dennd6bQ9D9V7 585 aa22.35■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pi16Q9ET66 489 aa22.35■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atp1b2P14231 290 aa22.34■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Klk1b9P15949 261 aa22.34■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NelfeP19426 375 aa22.34■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 HmgclP38060 325 aa22.34■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Guca1aP43081 202 aa22.34■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lzts1P60853 599 aa22.34■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppp1r7Q3UM45 361 aa22.34■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Defb46Q4QY34 57 aa22.34■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr464Q5SW48 313 aa22.34■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zhx3Q8C0Q2 951 aa22.34■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Syngr3Q8R191 229 aa22.34■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rfpl4aQ8VH31 287 aa22.34■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pycr2Q922Q4 320 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc3Q9D6Y1 273 aa22.34■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Clca1Q9D7Z6 913 aa22.34■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cmtm7Q9ESD6 167 aa22.34■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Asb1Q9WV74 336 aa22.34■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Map1bP14873 2464 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm3952A0A0A6YXJ1 191 aa22.33■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tex13c2A0A0G2JGA3 530 aa22.33■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nt5c1aA3KFX0 365 aa22.33■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Skint11A7XV14 364 aa22.33■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dnajb3O35723 242 aa22.33■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Klc2O88448 599 aa22.33■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adh1P00329 375 aa22.33■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 P01673 111 aa22.33■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CryabP23927 175 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 St3gal1P54751 337 aa22.33■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CtnsP57757 367 aa22.33■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam160a1Q505K2 1081 aa22.33■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Taar7fQ5QD08 358 aa22.33■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ZpbpQ62522 350 aa22.33■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppp2r1bQ7TNP2 601 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SnupnQ80W37 358 aa22.33■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc181Q80ZU5 509 aa22.33■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ChfrQ810L3 664 aa22.33■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Morc4Q8BMD7 928 aa22.33■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Klhl7Q8BUL5 586 aa22.33■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfpm2Q8CCH7 1151 aa22.33■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Esrp2Q8K0G8 717 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arr3Q9EQP6 381 aa22.33■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc5a3Q9JKZ2 718 aa22.33■■□□□ 1.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ReckQ9Z0J1 971 aa22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.6 ms