RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581180.1

MKS1-210, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 2

Gene MKS1, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-210ENST00000581180 NRROSQ86YC3 692 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 DENND6AQ8IWF6 608 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 PALM2Q8IXS6 379 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 CCL4L1Q8NHW4 92 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 CALML6Q8TD86 181 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 GPBAR1Q8TDU6 330 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 UBXN4Q92575 508 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 FAM122AQ96E09 287 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 SGF29Q96ES7 293 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 DCUN1D1Q96GG9 259 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 TTC25Q96NG3 672 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 TTC1Q99614 292 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 GPSM3Q9Y4H4 160 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 V9GYY5 206 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 PRR19A6NJB7 356 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 OR2AG2A6NM03 316 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 C4orf47A7E2U8 309 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 KMOO15229 486 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 AQP9O43315 295 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 AP2A2O94973 939 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 S1PR4O95977 384 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 C1QAP02745 245 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 CD59P13987 128 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 CTSEP14091 401 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 SLC1A2P43004 574 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 PRLHRP49683 370 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 CTBSQ01459 385 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 SLC14A1Q13336 389 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 CTBP1Q13363 440 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 ZNF789Q5FWF6 425 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 STPG1Q5TH74 334 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 ZNF470Q6ECI4 717 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 CRTC3Q6UUV7 619 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 CAPN12Q6ZSI9 719 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 DET1Q7L5Y6 550 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 GATAD2AQ86YP4 633 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 OTUD6BQ8N6M0 293 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 LMX1AQ8TE12 382 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 LPGAT1Q92604 370 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 TIMM29Q9BSF4 260 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 P2RY12Q9H244 342 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 NINJ2Q9NZG7 142 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 GULP1Q9UBP9 304 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 SLC23A2Q9UGH3 650 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 FBXO5Q9UKT4 447 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 LMO7DNF2Z398 122 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 NDUFS3O75489 264 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 F7P08709 466 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 FAM153BP0C7A2 387 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 ACP5P13686 325 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 AK4P27144 223 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 PMLP29590 882 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 CLCNKAP51800 687 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 ADARP55265 1226 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 MPP1Q00013 466 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 MGAT5Q09328 741 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 LRP8Q14114 963 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 ELOCQ15369 112 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 KYNUQ16719 465 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 FAM153CQ494X1 144 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 WDR93Q6P2C0 686 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 ZNF449Q6P9G9 518 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 XKR5Q6UX68 686 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 CLDN19Q8N6F1 224 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 BIRC8Q96P09 236 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 GSDMCQ9BYG8 508 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 TXLNGYQ9BZA5 131 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 SMYD2Q9NRG4 433 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms