RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580799.2

GGA3-210, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 5

Gene GGA3, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-210	ENST00000580799	BPI	P17213	487 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	ZBED6	P86452	979 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	CDK18	Q07002	472 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	ZBTB17	Q13105	803 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	TUBB3	Q13509	450 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	SEMA5A	Q13591	1074 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	GTF2H3	Q13889	308 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	PDK1	Q15118	436 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	UGT8	Q16880	541 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	C4orf17	Q53FE4	359 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	VSIG1	Q86XK7	387 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	KMT5C	Q86Y97	462 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	CT55	Q8WUE5	264 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	TADA1	Q96BN2	335 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	TTC25	Q96NG3	672 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	CD180	Q99467	661 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	ACTL8	Q9H568	366 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	LHX9	Q9NQ69	397 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	RARRES3	Q9UL19	164 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	NBAS	A2RRP1	2371 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-210	ENST00000580799	TTLL8	A6PVC2	850 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	MTX2	O75431	263 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	NDST3	O95803	873 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	SLC4A1	P02730	911 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	FECH	P22830	423 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	KDELR1	P24390	212 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	HMGCL	P35914	325 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	PGD	P52209	483 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	TAS2R40	P59535	323 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	PDE1B	Q01064	536 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	ACY1	Q03154	408 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	DMPK	Q09013	629 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	AP1B1	Q10567	949 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	H2AFV	Q71UI9	128 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	SYVN1	Q86TM6	617 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	TMEM135	Q86UB9	458 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	AMZ2	Q86W34	360 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	PLD5	Q8N7P1	536 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	OR8K5	Q8NH50	307 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	AGAP3	Q96P47	875 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	TRABD	Q9H4I3	376 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	CBX8	Q9HC52	389 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	FGF21	Q9NSA1	209 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	LRRD1	A4D1F6	860 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	TLCD2	A6NGC4	264 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	AGFG2	O95081	481 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	TIAF1	O95411	115 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	PTPN4	P29074	926 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	PBX1	P40424	430 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	ARL4D	P49703	201 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	TPM4	P67936	248 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	HSD11B2	P80365	405 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	PLCL1	Q15111	1095 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	PCSK7	Q16549	785 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	CARF	Q8N187	725 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	GDAP1	Q8TB36	358 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	RAPGEF5	Q92565	580 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	RNF31	Q96EP0	1072 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	OLFM3	Q96PB7	478 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-210	ENST00000580799	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		10.07	□□□□□ -0.8

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