RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF132P52740 706 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRM-211ENST00000580170 SULT2A1Q06520 285 aa21.16■□□□□ 0.98
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PTPRM-211ENST00000580170 AP2M1Q96CW1 435 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRM-211ENST00000580170 AIF1LQ9BQI0 150 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRM-211ENST00000580170 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGEF33A8MVX0 844 aa21.16■□□□□ 0.98
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PTPRM-211ENST00000580170 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
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PTPRM-211ENST00000580170 H3BM21 787 aa21.14■□□□□ 0.97
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PTPRM-211ENST00000580170 TRPM4Q8TD43 1214 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-211ENST00000580170 XAGE5Q8WWM1 108 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-211ENST00000580170 SLC25A51Q9H1U9 297 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-211ENST00000580170 TRPS1Q9UHF7 1281 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-211ENST00000580170 FZD10Q9ULW2 581 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-211ENST00000580170 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
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