RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCZ1BP86790 482 aa16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
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CCNDBP1-211ENST00000567434 SSUH2Q9Y2M2 353 aa16.81■□□□□ 0.28
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CCNDBP1-211ENST00000567434 STYXQ8WUJ0 223 aa16.8■□□□□ 0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 DCUN1D1Q96GG9 259 aa16.8■□□□□ 0.28
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CCNDBP1-211ENST00000567434 KCTD3Q9Y597 815 aa16.8■□□□□ 0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa16.8■□□□□ 0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLK10O43240 276 aa16.79■□□□□ 0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 SUN1O94901 812 aa16.79■□□□□ 0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 IFNB1P01574 187 aa16.79■□□□□ 0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 BRAFP15056 766 aa16.79■□□□□ 0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC19A1P41440 591 aa16.79■□□□□ 0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 CTSCP53634 463 aa16.79■□□□□ 0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDH17Q12864 832 aa16.79■□□□□ 0.28
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