RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	AADACL2	Q6P093	401 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TSSK4	Q6SA08	328 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SIAH3	Q8IW03	269 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	DNASE1L2	Q92874	299 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM186	Q96B77	213 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PTER	Q96BW5	349 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MOAP1	Q96BY2	351 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	LMLN	Q96KR4	655 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	NLRP4	Q96MN2	994 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	FCRL5	Q96RD9	977 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PAFAH2	Q99487	392 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	NUAK2	Q9H093	628 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ISCU	Q9H1K1	167 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PLK3	Q9H4B4	646 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	OLAH	Q9NV23	265 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	FETUB	Q9UGM5	382 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB21	Q9UL25	225 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MKLN1	Q9UL63	735 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CMAHP	Q9Y471	501 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP8B3	O60423	1300 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KDR	P35968	1356 aa		2.81	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0G2JK05	382 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1B0GWJ7	208 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	LNP1	A1A4G5	178 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CLIC2	O15247	247 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC25A17	O43808	307 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	BBOX1	O75936	387 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CGA	P01215	116 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KLKB1	P03952	638 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	HMOX1	P09601	288 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CTPS1	P17812	591 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MATN1	P21941	496 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ACHE	P22303	614 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MYF6	P23409	242 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PRPH2	P23942	346 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KLRC2	P26717	231 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CDC25C	P30307	473 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	IDUA	P35475	653 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MAGEA4	P43358	317 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	RABIF	P47224	123 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ARSE	P51690	589 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	JAK3	P52333	1124 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	OAZ1	P54368	228 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	IDI1	Q13907	227 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPRCAP	Q14761	206 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CDO1	Q16878	200 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	LETM2	Q2VYF4	491 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	GXYLT1	Q4G148	440 aa		2.8	□□□□□ -1.96

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