RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559834.1

HDDC3-204, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene HDDC3, Length 1,076 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-204ENST00000559834 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa9.01□□□□□ -0.97
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HDDC3-204ENST00000559834 VSIG1Q86XK7 387 aa9.01□□□□□ -0.97
HDDC3-204ENST00000559834 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.01□□□□□ -0.97
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HDDC3-204ENST00000559834 GDAP1Q8TB36 358 aa9.01□□□□□ -0.97
HDDC3-204ENST00000559834 THAP4Q8WY91 577 aa9.01□□□□□ -0.97
HDDC3-204ENST00000559834 RAPGEF5Q92565 580 aa9.01□□□□□ -0.97
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HDDC3-204ENST00000559834 TRIB3Q96RU7 358 aa9.01□□□□□ -0.97
HDDC3-204ENST00000559834 ANP32EQ9BTT0 268 aa9.01□□□□□ -0.97
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HDDC3-204ENST00000559834 ZNF711Q9Y462 761 aa9.01□□□□□ -0.97
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HDDC3-204ENST00000559834 TTLL8A6PVC2 850 aa9□□□□□ -0.97
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HDDC3-204ENST00000559834 PBX1P40424 430 aa9□□□□□ -0.97
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HDDC3-204ENST00000559834 AMZ2Q86W34 360 aa9□□□□□ -0.97
HDDC3-204ENST00000559834 KMT5CQ86Y97 462 aa9□□□□□ -0.97
HDDC3-204ENST00000559834 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa9□□□□□ -0.97
HDDC3-204ENST00000559834 ZNF547Q8IVP9 402 aa9□□□□□ -0.97
HDDC3-204ENST00000559834 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
HDDC3-204ENST00000559834 PLD5Q8N7P1 536 aa9□□□□□ -0.97
HDDC3-204ENST00000559834 DTX3LQ8TDB6 740 aa9□□□□□ -0.97
HDDC3-204ENST00000559834 RSC1A1Q92681 617 aa9□□□□□ -0.97
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HDDC3-204ENST00000559834 ARMC6Q6NXE6 501 aa8.99□□□□□ -0.97
HDDC3-204ENST00000559834 CPNE8Q86YQ8 564 aa8.99□□□□□ -0.97
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HDDC3-204ENST00000559834 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
HDDC3-204ENST00000559834 TPM3P06753 285 aa8.98□□□□□ -0.97
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