RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556274.5

ATXN3-237, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 913 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-237ENST00000556274 NDUFA10O95299 355 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 SEMA4FO95754 770 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 RETP07949 1114 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 KRT7P08729 469 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 TDGF1P13385 188 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 MTHFD2P13995 350 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 GNSP15586 552 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 COMTP21964 271 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 KDELR1P24390 212 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 IL1R2P27930 398 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 HOXA6P31267 233 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 GKP32189 559 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 ACSL1P33121 698 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 PCK1P35558 622 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 P2RY2P41231 377 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 ARHGAP25P42331 645 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 PTGER3P43115 390 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 COPAP53621 1224 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 GSCP56915 257 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 TAS2R40P59535 323 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 KRTAP10-2P60368 255 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 DYNLT1P63172 113 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 ZNF33AQ06730 810 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 SLC20A2Q08357 652 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 CCDC15Q0P6D6 951 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 ICAM4Q14773 271 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 GRM7Q14831 915 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 CST6Q15828 149 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 C5orf22Q49AR2 442 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 WDR45BQ5MNZ6 344 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 CFAP58Q5T655 872 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 DCAF12L1Q5VU92 463 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 FAM46CQ5VWP2 391 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 LYSMD4Q5XG99 296 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 TMCO3Q6UWJ1 677 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 ZNF783Q6ZMS7 281 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 RFX8Q6ZV50 586 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 DAAM2Q86T65 1068 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 TTC7BQ86TV6 843 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 RHOT2Q8IXI1 618 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 CCDC170Q8IYT3 715 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 ZNF683Q8IZ20 524 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 UNC5BQ8IZJ1 945 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 ACRBPQ8NEB7 543 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 PIK3C3Q8NEB9 887 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 OLIG1Q8TAK6 271 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 ALG14Q96F25 216 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 LMLNQ96KR4 655 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 GPHA2Q96T91 129 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 PSMB7Q99436 277 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 HEPHQ9BQS7 1158 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 DESI2Q9BSY9 194 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 BTBD1Q9H0C5 482 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 EPC1Q9H2F5 836 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 TMEM245Q9H330 911 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 MSL2Q9HCI7 577 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 FSCN3Q9NQT6 498 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 SEPT10Q9P0V9 454 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 TTLL3Q9Y4R7 772 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 HEY1Q9Y5J3 304 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 OR51B4Q9Y5P0 310 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 PCM1Q15154 2024 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 ANKRD12Q6UB98 2062 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 CACNA1HO95180 2353 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 UBE2QL1A1L167 161 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 PROB1E7EW31 1015 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 MCF2LO15068 1137 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 SLC31A1O15431 190 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 INSIG1O15503 277 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 PRAMEF4O60810 478 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 TMCC1O94876 653 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 POP4O95707 220 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-237ENST00000556274 IGSF6O95976 241 aa4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms