RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	SPC24	Q8NBT2	197 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	ZNF398	Q8TD17	642 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	LRRC45	Q96CN5	670 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	TTC25	Q96NG3	672 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	TAAR9	Q96RI9	348 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	DDA1	Q9BW61	102 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	ARL5A	Q9Y689	179 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137		F5H423	210 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	KRT86	O43790	486 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	SNX2	O60749	519 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	PRAMEF10	O60809	474 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	MTX2	O75431	263 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	CRTAM	O95727	393 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	FTCD	O95954	541 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	C9	P02748	559 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	CCL4	P13236	92 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	CXADR	P78310	365 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	XIAP	P98170	497 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	RHD	Q02161	417 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	NFATC2	Q13469	925 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	GTF2H3	Q13889	308 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	P3H1	Q32P28	736 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	AMZ2	Q86W34	360 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	JAML	Q86YT9	394 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	BMPER	Q8N8U9	685 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	GDAP1	Q8TB36	358 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	USP7	Q93009	1102 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	RAB33B	Q9H082	229 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	POT1	Q9NUX5	634 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137		H7C0S8	307 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	PSMD3	O43242	534 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	EFS	O43281	561 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	LDB2	O43679	373 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	PRAMEF1	O95521	474 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	VIP	P01282	170 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	CA5A	P35218	305 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	HADHA	P40939	763 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	ARSD	P51689	593 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	CTSC	P53634	463 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	RAB15	P59190	212 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	MC2R	Q01718	297 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	OLIG2	Q13516	323 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	GPR33	Q49SQ1	333 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	METRNL	Q641Q3	311 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	PCSK4	Q6UW60	755 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	NCSTN	Q92542	709 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	ULK4	Q96C45	1275 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CS-223	ENST00000551137	SPRY4	Q9C004	299 aa		11.28	□□□□□ -0.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms