RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	MIER2	Q8N344	545 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM136A	Q96C01	138 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ULK4	Q96C45	1275 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	OTUB2	Q96DC9	234 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF382	Q96SR6	550 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	CDRT15	Q96T59	188 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	RDH14	Q9HBH5	336 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	NCDN	Q9UBB6	729 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC78	A2IDD5	438 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	QSOX1	O00391	747 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	RAD51B	O15315	384 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	TBL1X	O60907	577 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	CRCP	O75575	148 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	LRG1	P02750	347 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	POU2F2	P09086	479 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	MTHFD2	P13995	350 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	TCF3	P15923	654 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	MC4R	P32245	332 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	MTHFR	P42898	656 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	MED21	Q13503	144 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	GALNT3	Q14435	633 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF460	Q14592	562 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	RPS6KA2	Q15349	733 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	GPSM1	Q86YR5	675 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	PHF21B	Q96EK2	531 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ALG14	Q96F25	216 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	B3GALT6	Q96L58	329 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	LRGUK	Q96M69	825 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	BIRC8	Q96P09	236 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	CLPB	Q9H078	707 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	RNF38	Q9H0F5	515 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	CROT	Q9UKG9	612 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	RAB26	Q9ULW5	256 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442		A0A0J9YYE9	177 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442		A6NHS1	94 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	AQP12B	A6NM10	295 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	AGAP14	A8MT82	685 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	NEMP1	O14524	444 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	AURKA	O14965	403 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ADAM12	O43184	909 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	AP1G1	O43747	822 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	CDK14	O94921	469 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	WDR47	O94967	919 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	BAG2	O95816	211 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	TRBC1	P01850	177 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	C7	P10643	843 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	HOXA9	P31269	272 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	GATM	P50440	423 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ERVFC1	P60507	584 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	PSME3	P61289	254 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	RHD	Q02161	417 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	KCNC3	Q14003	757 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	CCNI	Q14094	377 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	LRP8	Q14114	963 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	PFKFB4	Q16877	469 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54

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