RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549302.1

ARL1-206, Transcript of ADP ribosylation factor like GTPase 1, human

TSL 3

Gene ARL1, Length 725 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARL1-206	ENST00000549302	ITK	Q08881	620 aa		9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	IL11RA	Q14626	422 aa		9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	MARC1	Q5VT66	337 aa		9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	LRRC66	Q68CR7	880 aa		9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	MON1B	Q7L1V2	547 aa		9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	NEK11	Q8NG66	645 aa		9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	SCAMP4	Q969E2	229 aa		9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	AGPAT1	Q99943	283 aa		9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	ABCG8	Q9H221	673 aa		9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	PARVA	Q9NVD7	372 aa		9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	VPS18	Q9P253	973 aa		9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	PADI1	Q9ULC6	663 aa		9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	KCNK6	Q9Y257	313 aa		9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		9.51	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	RELN	P78509	3460 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302		A6NCN8	305 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	LILRA5	A6NI73	299 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	LRCH4	O75427	683 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	CREG1	O75629	220 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	DDAH2	O95865	285 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	CA4	P22748	312 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	F8A1	P23610	371 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	MMP13	P45452	471 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	HCAR3	P49019	387 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	KLK7	P49862	253 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	SEPHS1	P49903	392 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	JAM2	P57087	298 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	TRAF2	Q12933	501 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	CA9	Q16790	459 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	NPW	Q8N729	165 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	C9orf72	Q96LT7	481 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	TGM7	Q96PF1	710 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	OR6C1	Q96RD1	312 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	MGME1	Q9BQP7	344 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	RMI1	Q9H9A7	625 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		9.5	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302		A1L4Q6	167 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	MEGF11	A6BM72	1044 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	C21orf140	B9A014	251 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302		K7EM74	188 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	MTA2	O94776	668 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	UBXN7	O94888	489 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	EML2	O95834	649 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	RECK	O95980	971 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	SOD1	P00441	154 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	VIP	P01282	170 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	F3	P13726	295 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	TYRP1	P17643	537 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	TNFAIP3	P21580	790 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	SERPINB6	P35237	376 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	CDH6	P55285	790 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	MAX	P61244	160 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	PDE1B	Q01064	536 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	DNASE1L3	Q13609	305 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	THAP4	Q8WY91	577 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	RNF31	Q96EP0	1072 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		9.49	□□□□□ -0.89

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