RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547374.5

BRF1-210, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 5

Gene BRF1, Length 3,809 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-210	ENST00000547374	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	KRT87P	A6NCN2	255 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	TMEM247	A6NEH6	219 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374		M0R3G1	203 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	BMP2	P12643	396 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	SHMT2	P34897	504 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	BNIPL	Q7Z465	357 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	MON1A	Q86VX9	555 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	OR2T11	Q8NH01	316 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	CFAP99	D6REC4	459 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	ALPI	P09923	528 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	AQP1	P29972	269 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	BMX	P51813	675 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	EMP3	P54852	163 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	OXCT1	P55809	520 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	ATP6V0D1	P61421	351 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	BNIP2	Q12982	314 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	GPR162	Q16538	588 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	SFRP1	Q8N474	314 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	SLC15A4	Q8N697	577 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	ANKFN1	Q8N957	763 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	12.84	□□□□□ -0.35	4e-6	■■■■■ 41.2
BRF1-210	ENST00000547374	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	TOR3A	Q9H497	397 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	BAG5	Q9UL15	447 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374		G3V2T6	193 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	TCF3	P15923	654 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	FMO3	P31513	532 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	RFC2	P35250	354 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	TNK2	Q07912	1038 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	MAP2K5	Q13163	448 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	TUSC3	Q13454	348 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	GRB14	Q14449	540 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	CYP2A13	Q16696	494 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	OR2T12	Q8NG77	320 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	HM13	Q8TCT9	377 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	FRS2	Q8WU20	508 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	MYRFL	Q96LU7	910 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	HIPK3	Q9H422	1215 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	VPS45	Q9NRW7	570 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	AQP12B	A6NM10	295 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	SNAP91	O60641	907 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	PRKD3	O94806	890 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	B3GALT4	O96024	378 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	THRB	P10828	461 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	RHOQ	P17081	205 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	FSHR	P23945	695 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	IL12A	P29459	219 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	CYP2C18	P33260	490 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	NEK2	P51955	445 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	HUNK	P57058	714 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	TGFBI	Q15582	683 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	DET1	Q7L5Y6	550 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	DPY30	Q9C005	99 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	IPPK	Q9H8X2	491 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-210	ENST00000547374	STC1	P52823	247 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-210	ENST00000547374	FAM189B	P81408	668 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-210	ENST00000547374	CD300C	Q08708	224 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-210	ENST00000547374	DNASE1L3	Q13609	305 aa		12.83	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms