RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 BCL7AQ4VC05 210 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF438Q7Z4V0 828 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 CPT1BQ92523 772 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 HDAC10Q969S8 669 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 SH3KBP1Q96B97 665 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 GRAMD1AQ96CP6 724 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 SGF29Q96ES7 293 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 TTC1Q99614 292 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 PCYOX1Q9UHG3 505 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC162PA2VCL2 907 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 A6NCN8 305 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC188H7C350 402 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 PPM1DO15297 605 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 C1QTNF9P0C862 333 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 MGAT1P26572 445 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 ALDH4A1P30038 563 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 ETF1P62495 437 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 HHEXQ03014 270 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 ACVR1Q04771 509 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 DMPKQ09013 629 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 CAMK2BQ13554 666 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 NR1D2Q14995 579 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 ISXQ2M1V0 245 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 WASH2PQ6VEQ5 465 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF534Q76KX8 674 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 MCUQ8NE86 351 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 OR6P1Q8NGX9 317 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 SLCO2A1Q92959 643 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 WASH6PQ9NQA3 447 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 CHRAC1Q9NRG0 131 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 SPEGQ15772 3267 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 A0A1W2PQM1 296 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM8BA6NDV4 472 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 TRABD2BA6NFA1 517 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 GOT2P00505 430 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 MLNP12872 115 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 FOXN2P32314 431 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 HALP42357 657 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 B4GALNT1Q00973 533 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 ITIH4Q14624 930 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 AGAP9Q5VTM2 703 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 ANKRD22Q5VYY1 191 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 ARMC3Q5W041 872 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 KLHL7Q8IXQ5 586 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 OR4L1Q8NH43 312 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF778Q96MU6 729 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 SLC38A3Q99624 504 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 NRSN2Q9GZP1 204 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 VPS37BQ9H9H4 285 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 SYBUQ9NX95 663 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 ASIC3Q9UHC3 531 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 ANAPC5Q9UJX4 755 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-222ENST00000532751 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 MGAT4DA6NG13 374 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 OR51F1A6NGY5 319 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 PRR19A6NJB7 356 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 D6RAR5 112 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM63AO94886 807 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 PROS1P07225 676 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 PRSS56P0CW18 603 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 RPL10P27635 214 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 NSG1P42857 185 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 PRLHRP49683 370 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 OR1D5P58170 312 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 CRADDP78560 199 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 PTK6Q13882 451 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 DBN1Q16643 649 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 PCGF5Q86SE9 256 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 TRIM48Q8IWZ4 208 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 PPIL6Q8IXY8 311 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 PIANPQ8IYJ0 282 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 OR2L2Q8NH16 312 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 NXPE2Q96DL1 559 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 KCNK4Q9NYG8 393 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRK-222ENST00000532751 CPNE7Q9UBL6 633 aa21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms