RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532146.1

CELF1-216, Transcript of CUGBP Elav-like family member 1, human

TSL 3

Gene CELF1, Length 473 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF1-216	ENST00000532146	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	STK39	Q9UEW8	545 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	PADI3	Q9ULW8	664 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	SCML2	Q9UQR0	700 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	ASB3	Q9Y575	518 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	IRAK3	Q9Y616	596 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	FAM92A	A1XBS5	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	SEPT4	O43236	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	SLC7A4	O43246	635 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	AHCYL1	O43865	530 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	PMPCB	O75439	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	ZMPSTE24	O75844	475 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	BAG2	O95816	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	IGLV3-27	P01718	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	NTRK1	P04629	796 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	SCG5	P05408	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	ITGB1	P05556	798 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	FES	P07332	822 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	LYN	P07948	512 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	MMP2	P08253	660 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	RBP1	P09455	135 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	UQCRB	P14927	111 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	SAT1	P21673	171 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	YY1	P25490	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	CTGF	P29279	349 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	EPHA3	P29320	983 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	HOXC12	P31275	282 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	THPO	P40225	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	SLC26A3	P40879	764 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	MAGEA11	P43364	429 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	CCR10	P46092	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	LIMS1	P48059	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	PSMD8	P48556	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	ATP4B	P51164	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	RENBP	P51606	427 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	CLCN2	P51788	898 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	THOP1	P52888	689 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	NAGLU	P54802	743 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	AQP4	P55087	323 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	TBX4	P57082	545 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	ACVR1	Q04771	509 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	CTBP1	Q13363	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	RAB33A	Q14088	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	CSHL1	Q14406	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	SQLE	Q14534	574 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	TRIP10	Q15642	601 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	SFT2D3	Q587I9	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	PIGG	Q5H8A4	983 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	NEPRO	Q6NW34	567 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	KLC3	Q6P597	504 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	C14orf80	Q86SX3	495 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	KBTBD6	Q86V97	674 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	FAM129C	Q86XR2	697 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	TEX26	Q8N6G2	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	KY	Q8NBH2	561 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CELF1-216	ENST00000532146	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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