RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529667.1

SOX9-AS1-208, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 340 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 AIG1Q9NVV5 245 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ADA2Q9NZK5 511 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DKK3Q9UBP4 350 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LHX3Q9UBR4 397 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 VPS51Q9UID3 782 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.69□□□□□ -1.34
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.69□□□□□ -1.34
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa6.68□□□□□ -1.34
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 H0Y858 1186 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 BTN3A1O00481 513 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 E2F3O00716 465 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NEMP1O14524 444 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PER2O15055 1255 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 AHCYL1O43865 530 aa6.68□□□□□ -1.34
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 ULK1O75385 1050 aa6.68□□□□□ -1.34
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 DNAJB5O75953 348 aa6.68□□□□□ -1.34
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 FTH1P02794 183 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FESP07332 822 aa6.68□□□□□ -1.34
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 HGFP14210 728 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.342e-6■■□□□ 12
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 CYP2A7P20853 494 aa6.68□□□□□ -1.34
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 TLE2Q04725 743 aa6.68□□□□□ -1.34
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 GK3PQ14409 553 aa6.68□□□□□ -1.34
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 SEMA3AQ14563 771 aa6.68□□□□□ -1.34
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 REP15Q6BDI9 236 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TMEM207Q6UWW9 146 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LPCAT2Q7L5N7 544 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KDELC2Q7Z4H8 507 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TICAM1Q8IUC6 712 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NXPE1Q8N323 547 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NATD1Q8N6N6 113 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MFSD2AQ8NA29 543 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NETO2Q8NC67 525 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ACVR1CQ8NER5 493 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HM13Q8TCT9 377 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 AGR3Q8TD06 166 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CD200R1Q8TD46 325 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KCNV2Q8TDN2 545 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NRG4Q8WWG1 115 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ASZ1Q8WWH4 475 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EME1Q96AY2 570 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PTERQ96BW5 349 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LRRC58Q96CX6 371 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SPDL1Q96EA4 605 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MARK4Q96L34 752 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 COPS8Q99627 209 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa6.68□□□□□ -1.34
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