RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 OR51F1A6NGY5 319 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 CDRT15L2A8MXV6 281 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 PLD2O14939 933 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 SGTAO43765 313 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 TNFSF15O95150 251 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 RPL22P35268 128 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 ACTN2P35609 894 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 MAPK9P45984 424 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR3P46089 330 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 ARSDP51689 593 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 SEMA5AQ13591 1074 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 NFE2L1Q14494 772 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 CCNG2Q16589 344 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 FNBP1LQ5T0N5 605 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM220Q6QAJ8 160 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC89Q8N998 374 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR150Q8NGU9 434 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 FGF11Q92914 225 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 PMEPA1Q969W9 287 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 GRAMD1AQ96CP6 724 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 MS4A14Q96JA4 679 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM74Q96NL1 305 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC46A1Q96NT5 459 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC38A3Q99624 504 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 ZMYND15Q9H091 742 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB6BQ9NRW1 208 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 CPNE7Q9UBL6 633 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM8A1Q9UBU6 413 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 PISDQ9UG56 409 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 CRLS1Q9UJA2 301 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM208BQ5VWN6 2430 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 USP27XA6NNY8 438 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 AGAP14A8MT82 685 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 THRAP10827 490 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 MSH3P20585 1137 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 STIP1P31948 543 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 LONRF2Q1L5Z9 754 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 IGF2-ASQ6U949 168 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC9B2Q86UD5 537 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 NXPE1Q8N323 547 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC35F6Q8N357 371 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXO39Q8N4B4 442 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 PRELID2Q8N945 189 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 SGF29Q96ES7 293 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 TTC25Q96NG3 672 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 STRADBQ9C0K7 418 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0G2JNG1 304 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 KIR2DS3K7RE56 304 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 POP7O75817 140 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 SUN1O94901 812 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 ITGA2BP08514 1039 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 ITGALP20701 1170 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 FDFT1P37268 417 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC19A1P41440 591 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 PDE1BQ01064 536 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 KIR2DS5Q14953 304 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 CLCA4Q14CN2 919 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 TTC27Q6P3X3 843 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 SNX20Q7Z614 316 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 PIM3Q86V86 326 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC45Q96CN5 670 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 PDLIM2Q96JY6 352 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 THSD1Q9NS62 852 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 OGFRQ9NZT2 677 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 PAK5Q9P286 719 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMD13Q9UNM6 376 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 LHX6Q9UPM6 363 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 MROH6A6NGR9 719 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 E7EVH7 732 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 DUX1O43812 170 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 APRTP07741 180 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC2A4P14672 509 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 HADHAP40939 763 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCG1P45844 678 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 LMAN1P49257 510 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 LIMK2P53671 638 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 ERVPABLB-1P60509 514 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 DMPKQ09013 629 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 CDH17Q12864 832 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 CLEC14AQ86T13 490 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 AMZ2Q86W34 360 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 SPACA3Q8IXA5 215 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 PIANPQ8IYJ0 282 aa18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms