RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 VAPBO95292 243 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 DMPKQ09013 629 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 DBN1Q16643 649 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 BBS9Q3SYG4 887 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 PPM1JQ5JR12 505 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
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SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF547Q8IVP9 402 aa26.43■■□□□ 1.82
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SH3BP2-212ENST00000508338 CCL4L1Q8NHW4 92 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 CALML6Q8TD86 181 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 FOXP3Q9BZS1 431 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 PHACTR1Q9C0D0 580 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 PRKAB1Q9Y478 270 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 OR51F1A6NGY5 319 aa26.42■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 OR5K4A6NMS3 321 aa26.42■■□□□ 1.82
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SH3BP2-212ENST00000508338 CA5AP35218 305 aa26.42■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 PRLHRP49683 370 aa26.42■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
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SH3BP2-212ENST00000508338 GPR150Q8NGU9 434 aa26.42■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa26.42■■□□□ 1.82
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SH3BP2-212ENST00000508338 KLC4Q9NSK0 619 aa26.42■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM169AQ9Y6X4 670 aa26.42■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 OR2AG2A6NM03 316 aa26.41■■□□□ 1.82
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SH3BP2-212ENST00000508338 TRIM16O95361 564 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 B4GALNT1Q00973 533 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 TCEA2Q15560 299 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 LONRF1Q17RB8 773 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 SPANXN3Q5MJ09 141 aa26.41■■□□□ 1.82
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SH3BP2-212ENST00000508338 LRRC6Q86X45 466 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 GPR156Q8NFN8 814 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 SEC14L1Q92503 715 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 SGF29Q96ES7 293 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 TSSK1BQ9BXA7 367 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 CAAP1Q9H8G2 361 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
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SH3BP2-212ENST00000508338 C14orf28Q4W4Y0 310 aa26.4■■□□□ 1.82
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SH3BP2-212ENST00000508338 WASH2PQ6VEQ5 465 aa26.4■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 C11orf96Q7Z7L8 435 aa26.4■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC35F3Q8IY50 421 aa26.4■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 OTUD6BQ8N6M0 293 aa26.4■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 ART4Q93070 314 aa26.4■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 WASH6PQ9NQA3 447 aa26.4■■□□□ 1.82
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SH3BP2-212ENST00000508338 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
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SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF449Q6P9G9 518 aa26.39■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 CEP128Q6ZU80 1094 aa26.39■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 DET1Q7L5Y6 550 aa26.39■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP26.39■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 OR2L2Q8NH16 312 aa26.39■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa26.39■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 GRHL1Q9NZI5 618 aa26.39■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 SIRPGQ9P1W8 387 aa26.39■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 ACSL5Q9ULC5 683 aa26.39■■□□□ 1.82
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