RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498520.1

NDUFS1-210, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1, humanhuman

TSL 2

Gene NDUFS1, Length 593 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1-210ENST00000498520 ZNF840PA6NDX5 716 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 FAM47DPA6NHR8 397 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 HHLA1C9JL84 531 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 OLFM2O95897 454 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 MLNP12872 115 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 FAHP16930 419 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 GOT1P17174 413 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 GCAP28676 217 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 STX2P32856 288 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 P2RY2P41231 377 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 ELK3P41970 407 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 MSH2P43246 934 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 MAGEA11P43364 429 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 IL9RQ01113 521 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 TSPY1Q01534 308 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 SCAPQ12770 1279 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 SSPNQ14714 243 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 TMED2Q15363 201 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 DHCR24Q15392 516 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 FBXO43Q4G163 708 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 LCE4AQ5TA78 99 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 LGSNQ5TDP6 509 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 SYPL2Q5VXT5 272 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 C6orf89Q6UWU4 347 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 CYS1Q717R9 158 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 PIP4P1Q86T03 277 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 FAM131BQ86XD5 332 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 LRRC34Q8IZ02 419 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 CPA6Q8N4T0 437 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 OTUD6BQ8N6M0 293 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 CCDC185Q8N715 623 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 CCDC197Q8NCU1 140 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 RNF139Q8WU17 664 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 HTR3CQ8WXA8 447 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 PIGKQ92643 395 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 MYLPFQ96A32 169 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 GRAMD1AQ96CP6 724 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 CABS1Q96KC9 395 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 MAGEB18Q96M61 343 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 OLFM3Q96PB7 478 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 GCNAQ96QF7 691 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 SMC6Q96SB8 1091 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 ACOX2Q99424 681 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 ORAI3Q9BRQ5 295 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 BOCQ9BWV1 1114 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 TRABDQ9H4I3 376 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 KIF9Q9HAQ2 790 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 KLK13Q9UKR3 277 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 MMP17Q9ULZ9 603 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 YJEFN3A6XGL0 299 aa6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 E7ENQ6 273 aa6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 MYO1CO00159 1063 aa6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 MTSS1O43312 755 aa6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 OPHN1O60890 802 aa6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 RHOBTB1O94844 696 aa6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 TMEM63AO94886 807 aa6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 OAS1P00973 400 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 FYNP06241 537 aa6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 VIMP08670 466 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 CEACAM1P13688 526 aa6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 PFKLP17858 780 aa6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 SSTR1P30872 391 aa6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 HTR7P34969 479 aa6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 THBS2P35442 1172 aa6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 IFNAR2P48551 515 aa6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 CXCR3P49682 368 aa6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 SLC7A9P82251 487 aa6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 GBE1Q04446 702 aa6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 TAF10Q12962 218 aa6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 NME3Q13232 169 aa6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 SEMA5AQ13591 1074 aa6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 SPARCL1Q14515 664 aa6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 ITIH4Q14624 930 aa6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 PARP6Q2NL67 630 aa6.59□□□□□ -1.35
NDUFS1-210ENST00000498520 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58 ms