RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495653.1

PTPN23-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 23, human

TSL 2

Gene PTPN23, Length 676 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN23-205	ENST00000495653	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	HEATR9	A2RTY3	570 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	AGRP	O00253	132 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	CES2	O00748	559 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	SGTA	O43765	313 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	BRINP1	O60477	761 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	PHF2	O75151	1096 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	SLC2A4	P14672	509 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	BRAF	P15056	766 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	VCL	P18206	1134 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	IDS	P22304	550 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	CD1C	P29017	333 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	GPR3	P46089	330 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	INHBC	P55103	352 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	GABRE	P78334	506 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	CRADD	P78560	199 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	GPS1	Q13098	491 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	MAP9	Q49MG5	647 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	GPR33	Q49SQ1	333 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	AMZ2	Q86W34	360 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	ZNF778	Q96MU6	729 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	RANBP9	Q96S59	729 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	SLC38A3	Q99624	504 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	COPS8	Q99627	209 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	DKK4	Q9UBT3	224 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	SATB2	Q9UPW6	733 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653		A0A0G2JNG1	304 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	OR5K4	A6NMS3	321 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	CPNE6	O95741	557 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	RALB	P11234	206 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	TPSB2	P20231	275 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	ADRA1D	P25100	572 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	PSMA3	P25788	255 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	ACRV1	P26436	265 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	CSF2RB	P32927	897 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	CACNG1	Q06432	222 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	NFE2L1	Q14494	772 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	KCNJ11	Q14654	390 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	KIR2DS5	Q14953	304 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	TPSAB1	Q15661	275 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	ZNF534	Q76KX8	674 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	HDAC10	Q969S8	669 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	RAX	Q9Y2V3	346 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	CFAP99	D6REC4	459 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	FANCG	O15287	622 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	MGAT1	P26572	445 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	CCKBR	P32239	447 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	FOXN2	P32314	431 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	SLC19A1	P41440	591 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	MAPK9	P45984	424 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	LSS	P48449	732 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	CFHR1	Q03591	330 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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