RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495327.1

RBM28-208, Transcript of RNA binding motif protein 28, human

TSL 2

Gene RBM28, Length 395 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM28-208	ENST00000495327	NFATC2	Q13469	925 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	PTPRCAP	Q14761	206 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF398	Q8TD17	642 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	POT1	Q9NUX5	634 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	PDP2	Q9P2J9	529 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	ATM	Q13315	3056 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	SDK2	Q58EX2	2172 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	KLHL33	A6NCF5	533 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327		H7C0S8	307 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	BRAF	P15056	766 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	ITIH1	P19827	911 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	IDS	P22304	550 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	AKT1	P31749	480 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	CTSC	P53634	463 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	UCN	P55089	124 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	SPARCL1	Q14515	664 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	USP53	Q70EK8	1073 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	LINC00523	Q86TU6	105 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	AMZ2	Q86W34	360 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	ULK4	Q96C45	1275 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	CRELD1	Q96HD1	420 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	PRORY	Q9H606	182 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	ASB8	Q9H765	288 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	PISD	Q9UG56	409 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	KCTD3	Q9Y597	815 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	MSH3	P20585	1137 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	ITGAL	P20701	1170 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	PSMA3	P25788	255 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	SLC5A2	P31639	672 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	FDFT1	P37268	417 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	ETV5	P41161	510 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	SLC19A1	P41440	591 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	GPR33	Q49SQ1	333 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	BCL7A	Q4VC05	210 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	BROX	Q5VW32	411 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	SNX20	Q7Z614	316 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	NXPE1	Q8N323	547 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	TLR10	Q9BXR5	811 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	ZMYND15	Q9H091	742 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	OR2AG2	A6NM03	316 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	KLK10	O43240	276 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	SUN1	O94901	812 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	VIP	P01282	170 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	CD82	P27701	267 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	MC4R	P32245	332 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	HAL	P42357	657 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	TMPRSS3	P57727	454 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	CDH17	Q12864	832 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	CLN3	Q13286	438 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	SEMA5A	Q13591	1074 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	POU6F1	Q14863	301 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBM28-208	ENST00000495327	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms