RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	RUFY1	Q96T51	708 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF670	Q9BS34	389 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	LHX9	Q9NQ69	397 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	KCNK6	Q9Y257	313 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	MTOR	P42345	2549 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344		A0A0U1RQS6	177 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	CCDC66	A2RUB6	948 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF487	B1APH4	448 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	C21orf140	B9A014	251 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	PSMD11	O00231	422 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	DPM1	O60762	260 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	FTCD	O95954	541 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	TYRP1	P17643	537 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	MARCKSL1	P49006	195 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	DPT	Q07507	201 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	IL11RA	Q14626	422 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	CHRNA6	Q15825	494 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	UGT8	Q16880	541 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	VSIG1	Q86XK7	387 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	TTC13	Q8NBP0	860 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	THAP4	Q8WY91	577 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	FAF2	Q96CS3	445 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	AP2M1	Q96CW1	435 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	C19orf60	Q96EN9	201 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	RNF157	Q96PX1	679 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	ING2	Q9H160	280 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	ABCG8	Q9H221	673 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	HIVEP1	P15822	2718 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	LILRA5	A6NI73	299 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	DFFA	O00273	331 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	RASSF9	O75901	435 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	C9	P02748	559 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	MT-ND3	P03897	115 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	PRF1	P14222	555 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	SLC2A4	P14672	509 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	NFKBIA	P25963	317 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	RWDD2B	P57060	319 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	SLC6A19	Q695T7	634 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	SLC34A3	Q8N130	599 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	TRIM58	Q8NG06	486 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	EXD1	Q8NHP7	514 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	SEC14L1	Q92503	715 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	SPOCK2	Q92563	424 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	SCAMP4	Q969E2	229 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	MARVELD3	Q96A59	401 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	AGAP2	Q99490	1192 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	OGFR	Q9NZT2	677 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	PDZD2	O15018	2839 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344		A0A0G2JNG1	304 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344		A0A1W2PQ67	120 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	SOCS5	O75159	536 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	TIAF1	O95411	115 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	FGF5	P12034	268 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	ACP5	P13686	325 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	F3	P13726	295 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	CTPS1	P17812	591 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	SERPINB6	P35237	376 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	CDKN2B	P42772	138 aa		13.61	□□□□□ -0.23

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